More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3346 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3346  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
143 aa  291  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  61.43 
 
 
141 aa  175  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1995  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.11 
 
 
158 aa  110  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.07 
 
 
174 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.6 
 
 
163 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  47.32 
 
 
163 aa  102  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  46.46 
 
 
163 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  46.15 
 
 
163 aa  102  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3058  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.05 
 
 
159 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.86 
 
 
164 aa  97.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325867  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  48.51 
 
 
159 aa  97.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1535  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.28 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2797  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.75 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129572  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2770  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  38.75 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168453  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2814  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.75 
 
 
159 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3453  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.45 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1211  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  45.54 
 
 
153 aa  94.7  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3332  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.96 
 
 
163 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.760354  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.24 
 
 
156 aa  91.3  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2050  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.12 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.385935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.64 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.466878  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11560  cytosine/adenosine deaminase  40 
 
 
163 aa  87.8  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.48 
 
 
168 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.08 
 
 
163 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.32 
 
 
158 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.75 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.32 
 
 
157 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.71 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.28 
 
 
163 aa  80.1  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.21 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.824071 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.16 
 
 
158 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.37 
 
 
169 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.64 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.775972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.51 
 
 
180 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  36.11 
 
 
240 aa  77.4  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  40.66 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.66 
 
 
177 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0842  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.11 
 
 
178 aa  73.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.46 
 
 
169 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  35.92 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  36.89 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.18 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  29.8 
 
 
182 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4186  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.78 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.42 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  34.27 
 
 
564 aa  67.8  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  36.46 
 
 
158 aa  67.4  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.73 
 
 
159 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.42 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  33.62 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37 
 
 
161 aa  65.5  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  33.33 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.94 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.29 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  34.38 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.19 
 
 
174 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.46 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.48 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.63 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.63 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37349  predicted protein  38.54 
 
 
170 aa  63.5  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00419932  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.11 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  29.81 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  34.69 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0103  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.11 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  34.31 
 
 
151 aa  61.6  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.7 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.69 
 
 
166 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.77 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3962  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.85 
 
 
158 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  37.23 
 
 
157 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.73 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.69 
 
 
164 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.78 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  33.33 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.58 
 
 
146 aa  60.5  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0774  hypothetical protein  34.29 
 
 
166 aa  60.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00906515  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.58 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
163 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.89 
 
 
155 aa  60.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.2 
 
 
521 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.98 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  30.3 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  30.3 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  34.69 
 
 
159 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.43 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  30.53 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  36.36 
 
 
186 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2031  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.31 
 
 
195 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.64 
 
 
161 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  36.17 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.21 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  29.81 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.02 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35 
 
 
181 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.67 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  32.41 
 
 
190 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37 
 
 
223 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.08 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>