184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3332 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3332  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
163 aa  331  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.760354  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3058  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  79.11 
 
 
159 aa  250  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2770  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  70.7 
 
 
159 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168453  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2814  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  70.7 
 
 
159 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2797  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  70.7 
 
 
159 aa  234  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129572  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  68.79 
 
 
163 aa  223  1e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.32 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325867  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3453  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  66.44 
 
 
157 aa  209  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  64.47 
 
 
163 aa  208  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  66.67 
 
 
163 aa  206  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  63.76 
 
 
159 aa  199  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1211  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  62.84 
 
 
153 aa  197  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11560  cytosine/adenosine deaminase  61.18 
 
 
163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1535  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.21 
 
 
159 aa  185  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  63.82 
 
 
163 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2050  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.84 
 
 
165 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.385935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  53.21 
 
 
141 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1995  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  45.45 
 
 
158 aa  95.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3346  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.96 
 
 
143 aa  92.8  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.67 
 
 
163 aa  90.1  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.62 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.96 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.81 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.466878  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.24 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.22 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.14 
 
 
169 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3962  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.93 
 
 
158 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.62 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.01 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0842  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.77 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.19 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.775972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.78 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.12 
 
 
169 aa  70.5  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  30.67 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.81 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.67 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.04 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.54 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2431  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.19 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.29 
 
 
180 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.824071 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41 
 
 
145 aa  63.2  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4186  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.52 
 
 
180 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.29 
 
 
180 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.72 
 
 
176 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.24 
 
 
163 aa  61.6  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.35 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.59 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  38.83 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.59 
 
 
521 aa  58.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  32.93 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  32.08 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1071  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.28 
 
 
187 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45442  normal  0.648956 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  42 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.41 
 
 
161 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0774  hypothetical protein  33.8 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00906515  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.23 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.79 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.24 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  35.35 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  34.82 
 
 
564 aa  55.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.9 
 
 
150 aa  54.7  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  35.05 
 
 
150 aa  54.3  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  38.46 
 
 
147 aa  53.9  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
214 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.04 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  43.16 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  34.21 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.96 
 
 
155 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1447  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.38 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  34.38 
 
 
156 aa  52  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32 
 
 
162 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.19 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.39 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  31.48 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.79 
 
 
223 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  34.58 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.34 
 
 
211 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.45 
 
 
164 aa  50.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  31.13 
 
 
176 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.14 
 
 
161 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1498  zinc-binding domain-containing protein  26.35 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.216945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.11 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  34.04 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.73 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37349  predicted protein  30.19 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00419932  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  34.31 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  33.98 
 
 
193 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.42 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.11 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.38 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  30.88 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0231  hypothetical protein  28.18 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  36.19 
 
 
182 aa  48.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  38.54 
 
 
164 aa  48.1  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 
159 aa  47.4  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.58 
 
 
152 aa  47.4  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  31.25 
 
 
174 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  35.96 
 
 
153 aa  47  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.92 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>