More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4125 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  100 
 
 
159 aa  319  8e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  85.9 
 
 
163 aa  276  9e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1211  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  84.87 
 
 
153 aa  266  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3453  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  76.43 
 
 
157 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11560  cytosine/adenosine deaminase  73.08 
 
 
163 aa  239  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  74.84 
 
 
164 aa  235  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325867  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1535  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  68.79 
 
 
159 aa  224  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2797  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.74 
 
 
159 aa  217  6e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129572  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2770  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  67.74 
 
 
159 aa  217  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168453  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2814  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  67.74 
 
 
159 aa  217  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  68.21 
 
 
163 aa  207  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  64.29 
 
 
163 aa  201  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3332  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  63.76 
 
 
163 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.760354  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3058  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  63.58 
 
 
159 aa  197  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2050  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  60.67 
 
 
165 aa  187  5e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.385935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  57.72 
 
 
163 aa  168  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  47.01 
 
 
141 aa  105  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.18 
 
 
163 aa  104  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3346  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.51 
 
 
143 aa  97.8  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.42 
 
 
174 aa  97.1  9e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1995  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.47 
 
 
158 aa  94.4  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.75 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.37 
 
 
170 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.775972 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.89 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.1 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3962  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
158 aa  89  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.04 
 
 
154 aa  87.8  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.466878  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0842  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.66 
 
 
178 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.6 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.36 
 
 
163 aa  80.5  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.01 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.11 
 
 
169 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.74 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.23 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  38.46 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.42 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.5 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.17 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.38 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.34 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.824071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0774  hypothetical protein  39.47 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00906515  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4186  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.76 
 
 
180 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.58 
 
 
160 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  40.54 
 
 
564 aa  72  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.64 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.93 
 
 
168 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  36.43 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.29 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  34.06 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.59 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.65 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2431  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.03 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.1 
 
 
169 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.11 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.31 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  32.84 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.43 
 
 
223 aa  64.3  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  35 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.58 
 
 
190 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.95 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.79 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.46 
 
 
152 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.78 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.62 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.14 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  37 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  32.62 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.79 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.76 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  40.57 
 
 
186 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  38.83 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.87 
 
 
214 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.38 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  39.22 
 
 
521 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.37 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  40.43 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5437  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.11 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.647105  normal  0.506194 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1447  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.08 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
158 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.31 
 
 
155 aa  58.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0215  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.88 
 
 
159 aa  58.2  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1094  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.36 
 
 
119 aa  58.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  36.9 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.3 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  37.76 
 
 
193 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.74 
 
 
161 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.17 
 
 
155 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  33.33 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.45 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  36.59 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  32.46 
 
 
149 aa  55.1  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.58 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  37.5 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.63 
 
 
163 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.24 
 
 
150 aa  54.7  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0014  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  29.73 
 
 
156 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.58 
 
 
146 aa  54.3  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  28.48 
 
 
149 aa  54.7  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>