More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2431 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2431  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
194 aa  407  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3962  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.13 
 
 
158 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.5 
 
 
180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.824071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.5 
 
 
174 aa  186  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.88 
 
 
180 aa  184  9e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0774  hypothetical protein  55.63 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00906515  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.98 
 
 
166 aa  179  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.94 
 
 
170 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.775972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4186  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.9 
 
 
180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0842  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.37 
 
 
178 aa  158  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.02 
 
 
160 aa  158  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1094  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.99 
 
 
119 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.39 
 
 
163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.03 
 
 
158 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.51 
 
 
240 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.33 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.76 
 
 
169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.33 
 
 
157 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.4 
 
 
168 aa  107  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.45 
 
 
169 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.18 
 
 
169 aa  101  6e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.6 
 
 
171 aa  95.9  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1995  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.92 
 
 
158 aa  83.2  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.42 
 
 
176 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.95 
 
 
174 aa  79  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1211  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.29 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  30.97 
 
 
163 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  37.29 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2770  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  31.79 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168453  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2797  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.79 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129572  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2814  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.79 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  32.03 
 
 
159 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.8 
 
 
163 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.01 
 
 
174 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3332  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.19 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.760354  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  30.2 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  37.04 
 
 
157 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.62 
 
 
150 aa  63.9  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  31.54 
 
 
150 aa  63.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  30.46 
 
 
163 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.38 
 
 
146 aa  62.4  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  34.78 
 
 
149 aa  62  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.41 
 
 
163 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.38 
 
 
521 aa  61.6  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.24 
 
 
158 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1535  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.33 
 
 
159 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2031  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.9 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.43 
 
 
146 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0109  cytosine/adenosine deaminase  34.34 
 
 
148 aa  60.8  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.17 
 
 
164 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325867  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  37.27 
 
 
158 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4048  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.86 
 
 
144 aa  59.3  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.77 
 
 
145 aa  58.9  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.22 
 
 
146 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3172  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.62 
 
 
148 aa  58.9  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0411701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3453  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  30 
 
 
157 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  35.11 
 
 
167 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.11 
 
 
183 aa  58.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  38.32 
 
 
154 aa  58.2  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  32.87 
 
 
190 aa  57.8  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.33 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.466878  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9319  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.3 
 
 
154 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.74 
 
 
168 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.04 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.24 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.1 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.37 
 
 
157 aa  57  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.91 
 
 
162 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.46 
 
 
158 aa  56.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0908  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.42 
 
 
148 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2050  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  27.85 
 
 
165 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.385935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4089  tRNA-adenosine deaminase  37.63 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.47 
 
 
153 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0205  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  37.5 
 
 
157 aa  55.5  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.91 
 
 
165 aa  55.8  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  37.5 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3095  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34 
 
 
147 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.786655  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0798  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.45 
 
 
168 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.8 
 
 
158 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1272  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.78 
 
 
148 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.658036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0619  tRNA-adenosine deaminase  35.37 
 
 
174 aa  55.1  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.36 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  32.84 
 
 
147 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  33.68 
 
 
153 aa  54.7  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  34.48 
 
 
149 aa  54.7  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5985  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.46 
 
 
144 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.755307  normal  0.455465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2012  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.75 
 
 
178 aa  55.1  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.71 
 
 
159 aa  54.7  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11560  cytosine/adenosine deaminase  28.48 
 
 
163 aa  54.7  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0991  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  41.11 
 
 
539 aa  54.7  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0298578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1355  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.51 
 
 
148 aa  54.7  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.939679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.68 
 
 
147 aa  54.7  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  28.38 
 
 
564 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.64 
 
 
154 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2551  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  36.46 
 
 
148 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107388  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  29.86 
 
 
156 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3346  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.99 
 
 
143 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  36.36 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5394  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  33.33 
 
 
144 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  34.74 
 
 
144 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>