More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0991 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0991  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  100 
 
 
539 aa  1032    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0298578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.99 
 
 
521 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.31 
 
 
524 aa  307  4.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.43 
 
 
457 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.44 
 
 
485 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000793902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  35.11 
 
 
455 aa  160  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.07 
 
 
470 aa  160  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.5 
 
 
480 aa  158  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.49 
 
 
457 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  33.56 
 
 
468 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460009  hitchhiker  0.0000000000638883 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.81 
 
 
476 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.2 
 
 
471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.81 
 
 
470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.02 
 
 
454 aa  148  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  48.28 
 
 
160 aa  146  9e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.81 
 
 
456 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.87 
 
 
414 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  29.19 
 
 
476 aa  144  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.19 
 
 
476 aa  143  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.23 
 
 
476 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0608  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.66 
 
 
154 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.740984  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0498  cytosine deaminase, putative  53.62 
 
 
153 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.490204 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.29 
 
 
419 aa  140  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.26 
 
 
476 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.2 
 
 
476 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  28.01 
 
 
476 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  28.5 
 
 
476 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0483  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  54.37 
 
 
176 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.705581 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.5 
 
 
476 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  28.01 
 
 
476 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1340  cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region  52.41 
 
 
153 aa  139  2e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.296989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  43.27 
 
 
444 aa  139  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0668  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.72 
 
 
156 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  28.5 
 
 
476 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.18 
 
 
469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.39 
 
 
155 aa  137  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  34.69 
 
 
464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.36 
 
 
458 aa  136  8e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000325177  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  31.58 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.94 
 
 
469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1265  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.26 
 
 
470 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265542  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1942  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.28 
 
 
152 aa  134  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  50.71 
 
 
149 aa  133  9e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0624  tRNA-adenosine deaminase  45.52 
 
 
153 aa  133  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1494  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  37.89 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.763713  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0494  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.5 
 
 
465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0190  cytosine deaminase, putative  48.28 
 
 
153 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0645  tRNA-adenosine deaminase  52 
 
 
167 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954109  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0518  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  55.8 
 
 
158 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.63405  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  48.28 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.41 
 
 
475 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0139  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.5 
 
 
492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0622  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.18 
 
 
456 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.336141  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0964  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.1 
 
 
461 aa  128  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  38.1 
 
 
459 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50 
 
 
166 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0031  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.53 
 
 
148 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000369042  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.32 
 
 
174 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
676 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0106  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  37.82 
 
 
489 aa  126  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.31319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  55.56 
 
 
154 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  29.85 
 
 
454 aa  125  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.06 
 
 
436 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.934648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4636  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.74 
 
 
146 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  22.72 
 
 
457 aa  125  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167197  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2131  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.35 
 
 
151 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000198227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2521  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.06 
 
 
476 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000332242  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1551  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.54 
 
 
241 aa  124  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000725449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3763  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.42 
 
 
150 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253802  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.71 
 
 
446 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615384  normal  0.623923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  51.05 
 
 
144 aa  124  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.56 
 
 
472 aa  123  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2662  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.76 
 
 
474 aa  123  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0298541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  48.97 
 
 
146 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0612  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.75 
 
 
153 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  47.47 
 
 
177 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.68 
 
 
168 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.29 
 
 
363 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.65 
 
 
155 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.55 
 
 
152 aa  121  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  48.92 
 
 
163 aa  121  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3638  tRNA-adenosine deaminase  55 
 
 
160 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  21.85 
 
 
442 aa  121  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2012  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.21 
 
 
178 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.168679  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0294  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.55 
 
 
433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212762 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0839  tRNA-adenosine deaminase  48.61 
 
 
151 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.04 
 
 
431 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.992157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  28.54 
 
 
476 aa  120  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  44 
 
 
159 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1680  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.15 
 
 
142 aa  120  9e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0174432  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.52 
 
 
476 aa  119  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3696  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  54.29 
 
 
183 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0595885  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.56 
 
 
306 aa  119  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8570  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.9 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00354903  normal  0.0468884 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  45.45 
 
 
171 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  49.3 
 
 
168 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.53 
 
 
464 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1467  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.27 
 
 
338 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0235653 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.64 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0534  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.39 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>