More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2030 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2030  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
146 aa  301  2.0000000000000002e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000721347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2788  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  56.64 
 
 
158 aa  166  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0654304  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  53.85 
 
 
152 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.68 
 
 
164 aa  155  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.45 
 
 
152 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.67 
 
 
176 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3111  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  52.41 
 
 
157 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00240862  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  49.32 
 
 
165 aa  150  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  50.68 
 
 
168 aa  149  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.05 
 
 
175 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.05 
 
 
175 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.01 
 
 
181 aa  148  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000142338  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0065  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  54.55 
 
 
179 aa  147  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 
178 aa  147  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 
167 aa  147  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2834  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 
172 aa  146  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.730135 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2771  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 
172 aa  146  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2996  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.05 
 
 
174 aa  147  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.75 
 
 
169 aa  146  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2730  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 
172 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.635658  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  53.96 
 
 
163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.72 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.35 
 
 
175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2811  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2946  tRNA-specific adenosine deaminase  51.03 
 
 
172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.34 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3044  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.872342  normal  0.0227305 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 
200 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02453  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  50.34 
 
 
167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2711  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02417  hypothetical protein  50.34 
 
 
178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2712  tRNA-specific adenosine deaminase  50.34 
 
 
178 aa  144  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  45.52 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50.34 
 
 
177 aa  144  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 
187 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  50 
 
 
200 aa  144  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  49.66 
 
 
167 aa  143  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0741  cytidine and deoxycytidylate deaminase family protein  51.05 
 
 
177 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0888  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.05 
 
 
177 aa  144  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.63 
 
 
182 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.55 
 
 
164 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3524  tRNA-adenosine deaminase  52.41 
 
 
171 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4191  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  49.66 
 
 
159 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.63 
 
 
182 aa  142  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2018  tRNA-adenosine deaminase  47.92 
 
 
144 aa  142  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1317  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  48.97 
 
 
175 aa  141  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.63 
 
 
168 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50.69 
 
 
166 aa  141  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0280  tRNA-adenosine deaminase  50.35 
 
 
176 aa  140  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1986  tRNA-adenosine deaminase  47.26 
 
 
152 aa  139  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.365375  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  48.63 
 
 
183 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20800  tRNA-adenosine deaminase  47.55 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.3528e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3656  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.26 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.75 
 
 
178 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1846  tRNA-adenosine deaminase  48.95 
 
 
177 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.916039  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.28 
 
 
154 aa  138  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0777  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.15 
 
 
155 aa  138  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  48.95 
 
 
182 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  49.65 
 
 
154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.9 
 
 
223 aa  137  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.34 
 
 
177 aa  137  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0737  tRNA-specific adenosine deaminase  48.25 
 
 
148 aa  136  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0635  tRNA-specific adenosine deaminase  48.25 
 
 
148 aa  136  7.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.481891  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  51.15 
 
 
190 aa  136  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.34 
 
 
363 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0289  zinc-binding domain-containing protein  47.79 
 
 
137 aa  136  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  48.25 
 
 
193 aa  135  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0367  cytosine/adenosine deaminase  42.47 
 
 
160 aa  135  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1238  tRNA-adenosine deaminase  48.95 
 
 
222 aa  136  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1603  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  49.65 
 
 
161 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0633824  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1920  tRNA-adenosine deaminase  54.76 
 
 
196 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277263  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.85 
 
 
166 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  51.08 
 
 
189 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  48.28 
 
 
165 aa  134  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2035  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.98 
 
 
231 aa  134  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0981147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0013  hypothetical protein  46.15 
 
 
151 aa  134  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000252281  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.59 
 
 
165 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1609  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
165 aa  134  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0448042  normal  0.295189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15680  hypothetical protein  53.54 
 
 
182 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0652995  hitchhiker  0.000000000000295358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1748  tRNA-adenosine deaminase  50 
 
 
205 aa  133  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00208224  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2202  tRNA-adenosine deaminase  46.21 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  45.21 
 
 
166 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.21 
 
 
164 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3399  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.06 
 
 
154 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.837271  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.61 
 
 
158 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  49.31 
 
 
158 aa  133  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1307  tRNA-adenosine deaminase  50.78 
 
 
222 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.06 
 
 
154 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3536  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.39 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  50.35 
 
 
155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.28 
 
 
189 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0202  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  50.4 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  45.52 
 
 
161 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0230  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  50 
 
 
165 aa  131  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.0212463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  47.55 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1236  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  48.46 
 
 
252 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.469544  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  48.25 
 
 
149 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  49.32 
 
 
168 aa  130  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>