271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11560 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_11560  cytosine/adenosine deaminase  100 
 
 
163 aa  323  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  71.17 
 
 
163 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  73.08 
 
 
159 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1211  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  73.33 
 
 
153 aa  232  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3453  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  71.79 
 
 
157 aa  228  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1535  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  68.59 
 
 
159 aa  222  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  67.32 
 
 
164 aa  213  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325867  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2770  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  65.56 
 
 
159 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168453  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2814  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.56 
 
 
159 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2797  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  65.56 
 
 
159 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129572  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  64.71 
 
 
163 aa  205  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3058  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  59.24 
 
 
159 aa  200  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.09 
 
 
163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3332  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  61.18 
 
 
163 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.760354  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  58.28 
 
 
163 aa  168  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2050  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  52.26 
 
 
165 aa  167  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.385935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1995  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.74 
 
 
158 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  49.51 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.86 
 
 
163 aa  92.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.65 
 
 
158 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3346  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
143 aa  87.8  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.02 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.55 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.466878  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.9 
 
 
160 aa  79  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.21 
 
 
174 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.62 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.69 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  33.33 
 
 
240 aa  74.7  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.57 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0842  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.32 
 
 
178 aa  73.9  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.54 
 
 
170 aa  73.9  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.775972 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.2 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  46.24 
 
 
564 aa  72.8  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.26 
 
 
169 aa  70.9  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  33.33 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.68 
 
 
166 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.55 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  32.33 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.88 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.1 
 
 
169 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3962  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  30.91 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3254  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.33 
 
 
214 aa  63.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.23 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3479  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.18 
 
 
223 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.98 
 
 
155 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.6 
 
 
190 aa  62.4  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.64 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.45 
 
 
174 aa  62.4  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.62 
 
 
145 aa  62  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.23 
 
 
150 aa  61.6  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.11 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  32.32 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  38.38 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2794  Guanine deaminase  40.82 
 
 
186 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00026215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.41 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.14 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.14 
 
 
161 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.19 
 
 
180 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.824071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3424  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.42 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.628106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1282  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.62 
 
 
156 aa  58.5  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.16352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  31.85 
 
 
163 aa  57.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  31.34 
 
 
161 aa  57.8  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0144  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  36.17 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.263375  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37 
 
 
157 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.45 
 
 
155 aa  57.8  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06100  cytosine/adenosine deaminase  38.95 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2061  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.74 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448071  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4793  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36 
 
 
160 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.758133  normal  0.45937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8163  guanine deaminase  36.17 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.241917 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4186  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.66 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5383  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.23 
 
 
152 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3264  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  25.6 
 
 
211 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2814  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338742  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  38.95 
 
 
193 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4004  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.64 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0207982  hitchhiker  0.00540331 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1071  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.12 
 
 
187 aa  55.1  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.45442  normal  0.648956 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1670  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.29 
 
 
163 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0217007  normal  0.338032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1482  cytosine/adenosine deaminase  35.45 
 
 
149 aa  55.1  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.02 
 
 
164 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  37.78 
 
 
151 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.63 
 
 
162 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2431  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  28.48 
 
 
194 aa  54.7  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.52 
 
 
169 aa  54.7  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0774  hypothetical protein  34.06 
 
 
166 aa  54.7  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00906515  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.33 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.38 
 
 
158 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  40 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0136  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  33.33 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.41 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1419  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.68 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4251  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.65 
 
 
157 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.3601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1429  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.74 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000748458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1094  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.48 
 
 
119 aa  53.1  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  39.36 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  29.2 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1129  hypothetical protein  27.1 
 
 
154 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1134  hypothetical protein  27.1 
 
 
154 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  31 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0107  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.44 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0710056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.29 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>