More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1083 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  100 
 
 
169 aa  343  8e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  77.71 
 
 
171 aa  263  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  74.23 
 
 
176 aa  241  3.9999999999999997e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  44.83 
 
 
240 aa  138  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.42 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.97 
 
 
158 aa  124  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42.59 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.824071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.83 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  43.33 
 
 
180 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.88 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.46 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.61 
 
 
169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.38 
 
 
170 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.775972 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4186  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.49 
 
 
180 aa  106  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1995  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.56 
 
 
158 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3962  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.65 
 
 
158 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2431  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.18 
 
 
194 aa  101  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0774  hypothetical protein  41.06 
 
 
166 aa  101  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00906515  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.09 
 
 
158 aa  94.4  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.33 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0842  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.71 
 
 
178 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1618  tRNA-adenosine deaminase  49.47 
 
 
158 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  44.04 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2427  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.28 
 
 
174 aa  87.8  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.777873  normal  0.277053 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  43.27 
 
 
182 aa  87.8  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  45 
 
 
193 aa  86.3  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1158  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.48 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.325867  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.24 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.48 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  35.62 
 
 
564 aa  84.3  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.84 
 
 
174 aa  84.3  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  48.42 
 
 
150 aa  84  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  43.48 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.15 
 
 
155 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0109  cytosine/adenosine deaminase  40.74 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1251  tRNA-specific adenosine deaminase  43.12 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0516611  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  44.44 
 
 
524 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3621  tRNA-specific adenosine deaminase  43.12 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1145  tRNA-specific adenosine deaminase  43.12 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  43.14 
 
 
157 aa  82  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.18 
 
 
150 aa  82  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.84 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2050  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.53 
 
 
165 aa  80.9  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.385935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3324  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  35.96 
 
 
149 aa  80.5  0.000000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4719  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.4 
 
 
174 aa  80.9  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.267474  normal  0.468215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2142  tRNA-adenosine deaminase  36 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.79 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  42.11 
 
 
159 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5394  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.74 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  45.26 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.53 
 
 
168 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3115  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.57 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.08 
 
 
155 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42 
 
 
177 aa  79  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3619  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  47.96 
 
 
166 aa  78.6  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.53 
 
 
155 aa  78.6  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.659828  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00919  tRNA-specific adenosine deaminase  42.59 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0773913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0748  tRNA-specific adenosine deaminase  44.76 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.860443  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.56 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1535  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.28 
 
 
159 aa  77.4  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0415  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  48.96 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.605346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.57 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.44 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3540  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.54 
 
 
162 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955446 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2778  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  32.9 
 
 
165 aa  77  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01393  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.59 
 
 
223 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.331355  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2749  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.83 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.58237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.81 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1221  tRNA-specific adenosine deaminase  43.43 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3001  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.06 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.341603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0471  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  51.19 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  46.46 
 
 
157 aa  75.5  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1094  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.61 
 
 
119 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.8 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  35.86 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3054  tRNA-specific adenosine deaminase  42.42 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4143  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.87 
 
 
149 aa  75.1  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0816552 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.12 
 
 
521 aa  75.5  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  46.53 
 
 
168 aa  74.7  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.66 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2203  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.4 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.282185  normal  0.128098 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.38 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.38 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00130  tRNA-adenosine deaminase  44.55 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2644  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.43 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1831  guanine deaminase  42.37 
 
 
149 aa  74.3  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.358543  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  46.88 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1225  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.81 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.43 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.74 
 
 
175 aa  73.9  0.0000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1109  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  44.79 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  34.59 
 
 
153 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.1 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  44.79 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.89 
 
 
182 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0300  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.46 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.018226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2923  tRNA-specific adenosine deaminase  44.79 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  44.79 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>