More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1982 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1982  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 426 aa  808    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  34.93 
 
 		 394 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 394 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0610  putative two-component system sensor kinase  35.44 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  32.65 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  33.88 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  35.03 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  33.75 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.59 
 
 		 401 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  31.8 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  34.39 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  30.77 
 
 		 422 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6964  histidine kinase  33.78 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.198128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.91 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  28.19 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3997  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.2 
 
 		 567 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224789  normal  0.328912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  33.94 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  31.6 
 
 		 407 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.23 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  30.96 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  31.73 
 
 		 400 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 682 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  31.65 
 
 		 364 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0405  histidine kinase  34.56 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5894  histidine kinase  35.21 
 
 		 555 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  29.6 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  29.06 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  32.08 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 441 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 536 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2252  histidine kinase  34.34 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 414 aa  67  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  32.33 
 
 		 462 aa  66.6  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3230  histidine kinase  30.13 
 
 		 1033 aa  66.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.704109  normal  0.047539 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  32.2 
 
 		 378 aa  66.2  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  30.18 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  33.47 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0261  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.653023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  31.78 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.79 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 775 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 		 612 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 		 725 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4527  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.5 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  28.44 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  26.81 
 
 		 1046 aa  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  33.2 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.36 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  32.85 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  33.04 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.21 
 
 		 406 aa  63.2  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  35.59 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3178  histidine kinase  28.2 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  31.39 
 
 		 552 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.59 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  32.05 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  33.66 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3077  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  28.3 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  32.26 
 
 		 364 aa  62  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  29.38 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1142  Signal transduction histidine kinase  24.24 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  31.91 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.86 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  33.81 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.46 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  33.83 
 
 		 375 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3005  histidine kinase  37.44 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.165445  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  30.92 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  26.03 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 780 aa  60.1  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 485 aa  60.1  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 394 aa  60.1  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  30.88 
 
 		 423 aa  59.7  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 567 aa  59.7  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3218  histidine kinase  33.17 
 
 		 391 aa  59.7  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1114  histidine kinase  36.67 
 
 		 444 aa  59.7  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0404541  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 406 aa  59.7  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  33.82 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  30.47 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  31.13 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3064  putative signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 801 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.998121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2493  histidine kinase  31.11 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  26.46 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04490  signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1733  histidine kinase  35.57 
 
 		 385 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  30.19 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>