More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3178 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3178  histidine kinase  100 
 
 
430 aa  825    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  40.09 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  32.7 
 
 
395 aa  122  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.65 
 
 
379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  34.43 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  39.62 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
612 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
441 aa  113  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  30.56 
 
 
380 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  35.11 
 
 
423 aa  112  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0545  histidine kinase  34.27 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  36.21 
 
 
372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0233  putative two-component system sensor kinase  29.62 
 
 
379 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  34.63 
 
 
438 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  31.62 
 
 
422 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.62 
 
 
430 aa  106  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  34.84 
 
 
428 aa  106  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
394 aa  106  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  31.87 
 
 
399 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
420 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  34.58 
 
 
380 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  35.02 
 
 
402 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  34.3 
 
 
417 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2232  histidine kinase  35.42 
 
 
399 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000209414  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  36.23 
 
 
367 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  35.56 
 
 
421 aa  103  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  32.43 
 
 
399 aa  102  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4261  histidine kinase  34.44 
 
 
429 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  36.32 
 
 
428 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4835  histidine kinase  29.56 
 
 
414 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.951684  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
405 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
403 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
391 aa  101  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5192  histidine kinase  38.05 
 
 
445 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.532416  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
496 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  32.64 
 
 
422 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  30.83 
 
 
400 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
379 aa  99.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.59 
 
 
370 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1402  putative two-component system sensor kinase  35.63 
 
 
407 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.33 
 
 
406 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
445 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0809012  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  34.2 
 
 
408 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2556  histidine kinase  34.33 
 
 
416 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.121674  normal  0.0692801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  30.6 
 
 
442 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
426 aa  97.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  35.92 
 
 
410 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  34.06 
 
 
393 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  36.89 
 
 
392 aa  97.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2014  histidine kinase  37.85 
 
 
387 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  35.75 
 
 
369 aa  97.1  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  32.43 
 
 
405 aa  96.3  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  33.74 
 
 
430 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  33.76 
 
 
443 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
387 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
398 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  34.45 
 
 
375 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  29.1 
 
 
439 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  31.85 
 
 
470 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
423 aa  94  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
439 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.59 
 
 
430 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  34.5 
 
 
457 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.85 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  32.75 
 
 
408 aa  93.6  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  33.88 
 
 
447 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  32.52 
 
 
391 aa  93.2  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
398 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386955  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0550  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
382 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4946  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
793 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.137067  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0821  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
418 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1884  histidine kinase  36.71 
 
 
383 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0784201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  34.1 
 
 
388 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1319  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.57 
 
 
384 aa  91.3  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
445 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
421 aa  91.3  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0823  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
417 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.91 
 
 
424 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.67 
 
 
407 aa  90.5  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8899  histidine kinase  30.24 
 
 
455 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  33.47 
 
 
420 aa  90.5  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  29.64 
 
 
446 aa  90.1  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
382 aa  90.1  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  32.21 
 
 
372 aa  89.7  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5551  histidine kinase  33.18 
 
 
376 aa  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.476755  normal  0.129441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
441 aa  89.7  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
386 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  34.48 
 
 
408 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  34.18 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
444 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  34.23 
 
 
384 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.86 
 
 
400 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  31.36 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0608  histidine kinase  32.87 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0103  histidine kinase  34.47 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105504  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.33 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.67 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.204819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>