More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4527 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4527  Signal transduction histidine kinase-like protein  100 
 
 		 391 aa  769    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  34 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00220  signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 		 391 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3715  histidine kinase  34.72 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1990  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.48 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  31.4 
 
 		 394 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2269  histidine kinase  35.34 
 
 		 397 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000019217 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0652  histidine kinase  33 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  29.78 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5427  histidine kinase  32.99 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.315335 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  33.33 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3315  histidine kinase  32.34 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0173887  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  30.61 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2513  histidine kinase  32.37 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0276657  normal  0.73288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  33.02 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 407 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2671  histidine kinase  31.92 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.14 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 440 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3697  histidine kinase  32.76 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.8 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  31.02 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2269  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  31.32 
 
 		 446 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00214967  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  24.5 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  31.88 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  32.07 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3890  histidine kinase  32.94 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 401 aa  70.5  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274941  normal  0.123085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  31.02 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  23.31 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  27.8 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4434  histidine kinase  32.55 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.584475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  22.97 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  23.18 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2232  putative two-component sensor kinase  30.48 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  29.67 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1617  histidine kinase  31.02 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3054  histidine kinase  31.82 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.87 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  30.48 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1982  putative signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0277  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110389 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621089  normal  0.0286843 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.495846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  25.89 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 		 425 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3537  sensory Transduction Protein Kinase  23.61 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2025  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.720757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.62 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1803  putative sensor histidine kinase  23.18 
 
 		 366 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 612 aa  66.6  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1607  sensor histidine kinase  23.18 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  30.03 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  33.33 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1657  histidine kinase  21.23 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.174163  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1864  sensor histidine kinase, putative  23.61 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  23.38 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1840  putative sensor histidine kinase  22.94 
 
 		 368 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6162  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.38 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  decreased coverage  0.000124452 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  23.28 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1638  sensor histidine kinase  22.94 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000803844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  23.28 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3520  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.12 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.06 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4218  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.23 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0481493  hitchhiker  0.000385051 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1660  sensor histidine kinase  22.48 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1792  sensor histidine kinase  22.48 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  29.6 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  30.67 
 
 		 381 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  30.29 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  24.28 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6530  histidine kinase  28.05 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.475839  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1914  putative sensor histidine kinase  23.18 
 
 		 366 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.792707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  24.86 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.551521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  27.37 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  23.92 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2189  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 496 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000683339  hitchhiker  0.000292513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 468 aa  63.5  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  33.33 
 
 		 408 aa  63.5  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3323  histidine kinase  33.2 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0430816  normal  0.248964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  31.66 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  33.03 
 
 		 369 aa  63.2  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2532  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.7 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.76647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  24.04 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  28.7 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1301  histidine kinase  32.81 
 
 		 389 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.370703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>