227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3160 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3160  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 326 aa  647    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  99.67 
 
 		 449 aa  600  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 456 aa  600  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  59.34 
 
 		 446 aa  362  6e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  58.28 
 
 		 446 aa  332  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  43.11 
 
 		 468 aa  220  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  45.53 
 
 		 452 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  45.17 
 
 		 450 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  49.17 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  42.7 
 
 		 453 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  44.8 
 
 		 453 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  46.28 
 
 		 455 aa  208  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  38.93 
 
 		 444 aa  207  3e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  40 
 
 		 451 aa  203  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  42.66 
 
 		 457 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  41.41 
 
 		 470 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  39.35 
 
 		 455 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.06 
 
 		 391 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  39.59 
 
 		 455 aa  193  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  44.27 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  47.41 
 
 		 481 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.15 
 
 		 430 aa  189  5e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.43 
 
 		 409 aa  188  1e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  48.65 
 
 		 426 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  39.78 
 
 		 472 aa  185  8e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6194  Na+/H+ antiporter NhaA  37.71 
 
 		 379 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.219672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  41.67 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  41.15 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1563  pH-dependent sodium/proton antiporter  47.13 
 
 		 421 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.172648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4405  Na+/H+ antiporter NhaA  41.57 
 
 		 408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0840  Na+/H+ antiporter NhaA  43.7 
 
 		 381 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  39.53 
 
 		 395 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  38.51 
 
 		 451 aa  182  6e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  38.64 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  37.68 
 
 		 464 aa  182  8.000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0963  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.98 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000193238  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  39.93 
 
 		 475 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.87 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.34 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4144  Na+/H+ antiporter NhaA  36.15 
 
 		 472 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.375457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  43.22 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3129  Na+/H+ antiporter NhaA  43.41 
 
 		 422 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  35.31 
 
 		 450 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.35 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3856  Na+/H+ antiporter NhaA  43.02 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3089  Na+/H+ antiporter NhaA  37.6 
 
 		 406 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  37.92 
 
 		 435 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.34 
 
 		 391 aa  176  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  37.07 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.85 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  42.75 
 
 		 424 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1876  Na+/H+ antiporter  41.25 
 
 		 387 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181634 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.24 
 
 		 391 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.5 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  41.15 
 
 		 624 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.82 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  39.92 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.08 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.08 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.08 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.08 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.08 
 
 		 388 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  39.77 
 
 		 438 aa  173  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.5 
 
 		 394 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.5 
 
 		 389 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.5 
 
 		 389 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.5 
 
 		 389 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.5 
 
 		 389 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  37.25 
 
 		 400 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  41.67 
 
 		 404 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13458  putative Na+/H+ antiporter  38.84 
 
 		 427 aa  169  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.466525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3924  Na+/H+ antiporter NhaA  43.44 
 
 		 402 aa  169  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0288538  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.66 
 
 		 391 aa  169  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.02 
 
 		 397 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 395 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  38.78 
 
 		 438 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00018  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.46 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.89758  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.46 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.46 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  42.68 
 
 		 624 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00019  hypothetical protein  38.46 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.892896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3638  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.46 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.63 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.46 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.046286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.46 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.59 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0688  Na+/H+ antiporter NhaA  39.02 
 
 		 389 aa  166  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.5 
 
 		 389 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.08 
 
 		 388 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.453914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.76 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3578  Na+/H+ antiporter NhaA  38.08 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00256476  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.08 
 
 		 389 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.08 
 
 		 389 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3135  Na+/H+ antiporter NhaA  39.27 
 
 		 398 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  39.75 
 
 		 876 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1645  pH-dependent sodium/proton antiporter  32.79 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2015  pH-dependent sodium/proton antiporter  33.2 
 
 		 389 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3699  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.35 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.262179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.06 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  42.13 
 
 		 616 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>