More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0399 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0399  response regulator receiver protein  100 
 
 		 112 aa  230  5e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4016  DNA-binding transcriptional regulator BasR  34.31 
 
 		 222 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.727043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.66 
 
 		 220 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.66 
 
 		 220 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.66 
 
 		 220 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  30.69 
 
 		 245 aa  62  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  35.79 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1222  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.69 
 
 		 475 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0904  two component Fis family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 454 aa  62  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3836  DNA-binding transcriptional regulator BasR  33.33 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2121  osmolarity response regulator  30.69 
 
 		 248 aa  60.8  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.201602  normal  0.531848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0200  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.64 
 
 		 458 aa  60.5  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.162426  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0417  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 474 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.45134  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0852  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  60.1  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0690944  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1977  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0445  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.11 
 
 		 481 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0396  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.91 
 
 		 453 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.262789 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0628  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.19 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2913  two component transcriptional regulator  29.2 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2124  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.16 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0345179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3696  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0126  osmolarity response regulator  30.69 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3651  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 445 aa  58.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0135  osmolarity response regulator  30.69 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  33.02 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  33.02 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0353  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.47 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3049  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.11 
 
 		 445 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1620  two component transcriptional regulator  28.97 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0446  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.08 
 
 		 481 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0246  osmolarity response regulator  30.69 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0521802  normal  0.0191352 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0662  helix-turn-helix, Fis-type  33.33 
 
 		 451 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0271  osmolarity response regulator  30.69 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1627  two component transcriptional regulator  29.36 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0261  osmolarity response regulator  30.69 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0392  DNA-binding transcriptional regulator BasR  28.43 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.421328  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03881  fused DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with ZraS: response regulator/sigma54 interaction protein  28.71 
 
 		 441 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0124745  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1480  response regulator receiver protein  26.17 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.963077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5475  transcriptional regulatory protein ZraR  29 
 
 		 441 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3471  putative two-component response regulator  30.36 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03834  hypothetical protein  28.71 
 
 		 441 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0118236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4021  transcriptional regulatory protein ZraR  28.71 
 
 		 441 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0128092  normal  0.0227655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2297  putative PAS/PAC sensor protein  31.73 
 
 		 484 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0617558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4549  transcriptional regulatory protein ZraR  28.71 
 
 		 441 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000369022  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3989  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.71 
 
 		 441 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.716922  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0393  DNA-binding response regulator  30.28 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.632289  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4497  transcriptional regulatory protein ZraR  28.71 
 
 		 441 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000279415  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4966  osmolarity response regulator  30.69 
 
 		 246 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196418 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4454  transcriptional regulatory protein ZraR  28.71 
 
 		 441 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.209341  hitchhiker  0.000519331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1226  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.04 
 
 		 445 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4238  transcriptional regulatory protein ZraR  28.71 
 
 		 441 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.020936  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3924  response regulator receiver protein  29.52 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405001  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2164  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 461 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.340092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4252  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 461 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  30.19 
 
 		 250 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1098  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 461 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0965  two-component response regulator PilR  34.12 
 
 		 446 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.25964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0660  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 461 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1737  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 1037 aa  57.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.476029  normal  0.227269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2893  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.69 
 
 		 460 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321505  normal  0.0587462 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1140  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 461 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  30.19 
 
 		 247 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  30.19 
 
 		 247 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4840  two-component response regulator PilR  37.36 
 
 		 448 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  30.19 
 
 		 247 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  29.13 
 
 		 247 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  30.19 
 
 		 247 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1016  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 461 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0753  sigma-54 dependent response regulator  30.39 
 
 		 387 aa  57  0.00000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3686  response regulator  33.67 
 
 		 261 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  29.46 
 
 		 291 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2497  two component transcriptional regulator  33.65 
 
 		 239 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2142  two component transcriptional regulator  31.73 
 
 		 240 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.46457  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2623  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 456 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60260  two-component response regulator PilR  34.12 
 
 		 445 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000831057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1020  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5187  two-component response regulator PilR  34.12 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  32.08 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1479  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.26 
 
 		 445 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  30.3 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1402  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.73 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.154165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  31.68 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0911  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 456 aa  56.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.523432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  30.69 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  33.96 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3296  two component transcriptional regulator  26.55 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0513  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.985837  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0532  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.43 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00706375  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2826  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1797  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.67 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.774224  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2463  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.69 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2568  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.08 
 
 		 457 aa  55.5  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0491002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  30.09 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0092  two component transcriptional regulator  30.77 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1091  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 460 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4418  transcriptional regulatory protein ZraR  28.43 
 
 		 441 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.298897  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0583  two component transcriptional regulator  28.44 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  0.467543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  29.7 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>