78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0611 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0611  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 480 aa  985    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2967  Lytic transglycosylase catalytic  36.2 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.335517  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  36.42 
 
 		 194 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  37.14 
 
 		 241 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  36.09 
 
 		 199 aa  55.8  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  32.02 
 
 		 251 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  37.1 
 
 		 278 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  36.13 
 
 		 174 aa  54.7  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  38.32 
 
 		 238 aa  54.3  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  35.25 
 
 		 265 aa  53.5  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  27.13 
 
 		 709 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  36.54 
 
 		 198 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  31.61 
 
 		 204 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  40.37 
 
 		 254 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  38.24 
 
 		 260 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1632  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 222 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0239259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  39.32 
 
 		 677 aa  51.6  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  38.24 
 
 		 260 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  37.5 
 
 		 196 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0973  Lytic transglycosylase catalytic  42.73 
 
 		 318 aa  51.2  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 282 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  38.32 
 
 		 254 aa  50.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  37.84 
 
 		 272 aa  50.8  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  37.72 
 
 		 268 aa  50.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  35.77 
 
 		 245 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  36.28 
 
 		 206 aa  50.1  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 		 253 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  31.18 
 
 		 238 aa  50.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 258 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  29.26 
 
 		 271 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  35.77 
 
 		 258 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  37.86 
 
 		 208 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  31.93 
 
 		 241 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  35.09 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  26.99 
 
 		 709 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 		 217 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  35.45 
 
 		 310 aa  48.5  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  25.57 
 
 		 798 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  31.41 
 
 		 191 aa  48.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  38.1 
 
 		 336 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  37.74 
 
 		 338 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0476  lytic transglycosylase, catalytic  33.65 
 
 		 256 aa  47.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  26.72 
 
 		 247 aa  48.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  37.14 
 
 		 207 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3807  lytic transglycosylase, catalytic  31.85 
 
 		 215 aa  47  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  38.26 
 
 		 291 aa  47  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 261 aa  46.6  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  33.62 
 
 		 204 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1248  Lytic transglycosylase catalytic  31.06 
 
 		 175 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00404625  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 189 aa  46.6  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  34.51 
 
 		 195 aa  45.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  29.46 
 
 		 166 aa  45.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0975  Lytic transglycosylase catalytic  35.38 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.615186 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3565  Lytic transglycosylase catalytic  32.59 
 
 		 158 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  40.24 
 
 		 233 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1655  Lytic transglycosylase catalytic  35.65 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  39.22 
 
 		 217 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 439 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0846  lytic transglycosylase, catalytic  38.18 
 
 		 325 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3220  lytic transglycosylase, catalytic  35.19 
 
 		 212 aa  44.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 326 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0367  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 215 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0306  lytic transglycosylase, catalytic  31.54 
 
 		 293 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  29.46 
 
 		 717 aa  44.7  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1424  lytic transglycosylase, catalytic  37.37 
 
 		 191 aa  44.3  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0284128  normal  0.0259883 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  34.26 
 
 		 681 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 212 aa  43.9  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  36.04 
 
 		 235 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  35.96 
 
 		 301 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  32.39 
 
 		 209 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  35.14 
 
 		 233 aa  43.5  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  32.56 
 
 		 300 aa  43.5  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.36 
 
 		 257 aa  43.5  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  25.64 
 
 		 645 aa  43.5  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  34.58 
 
 		 296 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  32.76 
 
 		 204 aa  43.5  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 		 237 aa  43.1  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>