More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0120 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0120  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
257 aa  106  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.247011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.41 
 
 
260 aa  96.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.278227  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5440  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0792659  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3230  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
254 aa  95.5  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.272744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4890  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 
254 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0244727 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0080  short chain dehydrogenase  32.76 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104238  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 
268 aa  92.8  6e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
268 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0777  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.76 
 
 
249 aa  89.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2026  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.5 
 
 
227 aa  89  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.293852 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0727  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.15 
 
 
249 aa  89  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1276  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.127244 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0747  hypothetical protein  28.68 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.55 
 
 
223 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
266 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.81 
 
 
255 aa  86.7  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0765  hypothetical protein  28.29 
 
 
253 aa  86.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3955  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.32 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.572818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 
264 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314701  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4568  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.26 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0909607  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4245  short chain dehydrogenase  30.04 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.64 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53846  1-Acyl dihydroxyacetone phosphate reductase ribitol 2-dehydrogenase  32.09 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.51 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.96 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2639  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 
238 aa  82  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.37123  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05466  dehydrogenase oxidoreductase protein  27.16 
 
 
255 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.968817  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.97 
 
 
250 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38394  predicted protein  31.69 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00142595  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3382  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.33 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0982  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.31 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1111  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.98 
 
 
226 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3005  short chain dehydrogenase  30.71 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.702214  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4411  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6980  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4308  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  30.71 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0230  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.51 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.751134  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.438607  normal  0.336746 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5248  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0240  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.51 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5611  short chain dehydrogenase  31.76 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.637794  normal  0.281069 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0250  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.51 
 
 
453 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.366744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285018  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
287 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1341  3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  31.66 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000246645  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.42 
 
 
705 aa  79.3  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3595  tropinone reductase  31.25 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.855153  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0917  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.61 
 
 
249 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4073  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.95 
 
 
252 aa  79  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.576341  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2087  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.29 
 
 
259 aa  79  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
272 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01740  cytoplasm protein, putative  28.21 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672483  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.71 
 
 
267 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2503  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  30 
 
 
243 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.21 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  33.15 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4617  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.891469  hitchhiker  0.00163121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5008  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.83 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0468951  hitchhiker  0.00252787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0412  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.19 
 
 
477 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0813241 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.41 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.33 
 
 
383 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  28.81 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0259  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.07 
 
 
479 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.127513 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0497  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.94 
 
 
245 aa  77.8  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_5780  predicted protein  31.32 
 
 
194 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.155733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.1 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1917  short chain dehydrogenase  31.67 
 
 
248 aa  77  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.242165  hitchhiker  0.00000598098 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10245  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.19 
 
 
454 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.554646  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.32 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.209414  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.27 
 
 
247 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.07 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 
266 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1860  oxidoreductase  28.12 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.99 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.649424  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2775  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.56 
 
 
238 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.88847  normal  0.739494 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1476  oxidoreductase  28.12 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.23 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
255 aa  76.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0597317 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.87 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3469  putative short-chain dehydrogenase  31.14 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2097  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.27 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.434652  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.65 
 
 
257 aa  76.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.125705  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4442  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.43 
 
 
250 aa  76.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4758  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.15 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0212824 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4592  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.9 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2752  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.37 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.204437 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  27.47 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.9 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.607642  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.4 
 
 
272 aa  75.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>