More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2312 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2453  hypothetical protein  94.76 
 
 
535 aa  1004    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2312  hypothetical protein  100 
 
 
535 aa  1073    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1493  amino acid permease  37.98 
 
 
560 aa  357  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.613139  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0684  amino acid permease family protein  37.8 
 
 
560 aa  356  5e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0533  amino acid permease family protein  37.88 
 
 
531 aa  341  2e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1725  amino acid permease  37.2 
 
 
525 aa  326  6e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0462  amino acid permease family protein  36.69 
 
 
518 aa  324  3e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0022  amino acid permease  33.65 
 
 
542 aa  300  5e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1993  amino acid permease family protein  33.46 
 
 
542 aa  296  7e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0287  hypothetical protein  34.1 
 
 
521 aa  294  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0601  amino acid permease-associated region  35.12 
 
 
528 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0439  amino acid permease family protein  35.12 
 
 
528 aa  291  2e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6568  putative amino acid transporter  32.63 
 
 
533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2503  amino acid permease-associated region  33.4 
 
 
530 aa  287  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.701941  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03682  amino-acid permease transmembrane protein  32.65 
 
 
543 aa  283  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00632894  normal  0.215553 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4850  amino acid permease-associated region  32.65 
 
 
576 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.102365  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3773  amino acid permease-associated region  32.65 
 
 
544 aa  282  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2082  amino acid permease-associated region  37.47 
 
 
539 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2457  amino acid permease family protein  37.47 
 
 
539 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3527  amino acid permease-associated region  31.82 
 
 
555 aa  279  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238018  normal  0.261752 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1213  amino acid permease-associated region  32.14 
 
 
541 aa  278  2e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3180  amino acid permease  33.52 
 
 
528 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35942  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2863  amino acid permease  33.71 
 
 
528 aa  277  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.817081  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2109  amino acid permease-associated region  34.05 
 
 
537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5772  amino acid permease-associated region  32.44 
 
 
543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2726  amino acid permease-associated region  33.33 
 
 
530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0431  amino acid transporter  34.09 
 
 
517 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271358  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4472  amino acid permease-associated region  33.66 
 
 
533 aa  274  3e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299339  normal  0.878033 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1782  amino acid permease family protein  34.29 
 
 
539 aa  272  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0537506  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1459  amino acid permease-associated region  34.29 
 
 
539 aa  272  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3595  amino acid permease  33.86 
 
 
533 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.243323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3608  amino acid permease  33.86 
 
 
533 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2935  amino acid permease  33.66 
 
 
533 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3619  amino acid permease  33.86 
 
 
533 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0681  amino acid permease  34.34 
 
 
533 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0499  amino acid permease  34.34 
 
 
533 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1948  amino acid permease  34.34 
 
 
533 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0977  amino acid permease  34.34 
 
 
533 aa  266  8e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0435  amino acid permease-associated region  32.01 
 
 
532 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0857728  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2893  amino acid permease-associated region  32.95 
 
 
532 aa  261  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0706357  normal  0.902102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3592  amino acid transporter  31.82 
 
 
532 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.337468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0409  amino acid permease-associated region  31.82 
 
 
532 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.352811  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2241  amino acid permease family protein  34.17 
 
 
518 aa  259  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0948  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 
546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0158045  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0356  amino acid permease-associated region  30.77 
 
 
536 aa  252  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000370463  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0477  amino acid permease-associated region  32.2 
 
 
532 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.694981 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2601  amino acid permease-associated region  32.2 
 
 
532 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0504  amino acid permease-associated region  32.2 
 
 
532 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.907763  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5265  amino acid permease-associated region  31.24 
 
 
546 aa  250  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1000  amino acid permease-associated region  30.67 
 
 
529 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10831  hypothetical protein  34.64 
 
 
514 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2034  amino acid permease family protein  31.31 
 
 
559 aa  239  5.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000879129  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1691  amino acid permease-associated region  31.6 
 
 
522 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.677415  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2477  amino acid permease-associated region  31.26 
 
 
545 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000817564  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2309  amino acid permease-associated region  29.87 
 
 
543 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.22998  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2526  amino acid permease-associated region  31.26 
 
 
545 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000127161  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4132  amino acid permease-associated region  29.96 
 
 
537 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.402344  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0806  amino acid permease-associated region  32.03 
 
 
530 aa  231  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0501787 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1455  amino acid permease-associated region  32.49 
 
 
635 aa  229  1e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1259  amino acid ABC transporter permease  31.08 
 
 
537 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.507972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1286  amino acid permease-associated region  31.08 
 
 
537 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.473778 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1896  amino acid transporter  30.67 
 
 
541 aa  223  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.512532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4138  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 
541 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122354  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4228  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 
541 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0704647  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3381  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 
541 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.281924  normal  0.281793 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4449  amino acid permease-associated region  30.06 
 
 
541 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.724513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2069  amino acid permease  28.6 
 
 
541 aa  219  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03036  amino acid transporter  30.58 
 
 
516 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4030  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 
541 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.562876  normal  0.281547 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3549  amino acid permease-associated region  30.47 
 
 
541 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769299  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0469  amino acid permease  28.02 
 
 
541 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.343944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1885  amino acid permease  28.3 
 
 
664 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0567  amino acid permease  28.3 
 
 
666 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.23606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1836  amino acid permease-associated region  30.62 
 
 
521 aa  213  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0262  amino acid transporter  30.65 
 
 
491 aa  212  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01444  amino acid permease  30.75 
 
 
528 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2704  amino acid permease-associated region  31.09 
 
 
616 aa  208  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2044  amino acid permease-associated region  31.34 
 
 
647 aa  203  5e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1421  amino acid permease  27.53 
 
 
519 aa  203  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0140485  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2193  amino acid permease  27.53 
 
 
642 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.182525  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0878  amino acid permease  27.53 
 
 
642 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.487607  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2800  amino acid permease-associated region  31.56 
 
 
630 aa  194  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1258  amino acid permease-associated region  28.37 
 
 
576 aa  193  7e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000476519  hitchhiker  0.00000000276245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0129  amino acid permease-associated region  28.44 
 
 
614 aa  181  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0461  amino acid permease-associated region  24.44 
 
 
511 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0926  amino acid permease-associated region  24.39 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0361  amino acid permease-associated region  23.74 
 
 
539 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.741399  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  24.09 
 
 
503 aa  90.5  8e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0889  amino acid permease-associated region  24.06 
 
 
467 aa  83.6  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3325  amino acid permease-associated region  25.07 
 
 
471 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1192  phenylalanine-specific permease PheP  24.8 
 
 
475 aa  77  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4095  amino acid permease  24.33 
 
 
471 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  24.47 
 
 
488 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0510  amino acid permease-associated region  25.47 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0589175  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  22.42 
 
 
495 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  26.1 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1196  aromatic amino acid transport protein AroP  23.8 
 
 
475 aa  74.3  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  25.86 
 
 
476 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  28.04 
 
 
471 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  25.85 
 
 
471 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>