More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0332 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl0332  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  599  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0355  hypothetical protein  89.76 
 
 		 293 aa  542  1e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1760  hypothetical protein  37.8 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1760  hypothetical protein  37.11 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2050  hypothetical protein  35.84 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2060  hypothetical protein  35.15 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 321 aa  126  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  30.5 
 
 		 286 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 292 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1888  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0674933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  27.76 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 292 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1982  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.1 
 
 		 290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0403422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2172  transcriptional regulator, LysR family  26.72 
 
 		 290 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1414  LysR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832122 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  25.95 
 
 		 296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1993  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 293 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1575  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 278 aa  104  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.684291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1945  LysR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.551445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2651  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1555  LysR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3313  LysR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.600178  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0820  transcriptional regulator, LysR family  26.15 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1345  transcriptional regulator, LysR family  25.63 
 
 		 300 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0839604  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2640  RuBisCO operon transcriptional regulator  24.47 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1791  LysR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3255  LysR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 297 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.841591  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.34 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.34 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.34 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.34 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1902  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 292 aa  95.9  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0309  transcriptional regulator, LysR family protein  25.45 
 
 		 289 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  23.76 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2240  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 290 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.074644  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3192  LysR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 295 aa  95.1  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.863853  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  23.76 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1614  LysR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.625262  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0714  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 298 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3500  transcriptional regulator, LysR family  29.32 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3495  LysR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0190038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3285  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0242325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4855  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5338  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1717  transcriptional regulator  26.28 
 
 		 314 aa  94.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  27.56 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3482  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.97 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5293  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3543  LysR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.97 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0727  LysR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1599  transcriptional regulator, LysR family  25.78 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.546474 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4870  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1825  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.705034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2065  LysR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.102765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5664  transcriptional regulator, LysR family  27.57 
 
 		 297 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5263  transcriptional regulator, LysR family  27.21 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1976  transcriptional regulator, LysR family  27.45 
 
 		 343 aa  93.2  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66022  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1477  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1767  transcriptional regulator, LysR family  28.35 
 
 		 297 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.114066  normal  0.776401 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  26.79 
 
 		 294 aa  91.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0107  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.11 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0511  transcriptional regulator, LysR family  25.52 
 
 		 699 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00795049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2267  LysR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.211668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2227  LysR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000599262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3199  LysR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0827152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2671  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  24.69 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00916902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2435  LysR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0368529  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2080  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  25.2 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5025  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5406  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 297 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05450  transcriptional regulator, LysR family  25.94 
 
 		 296 aa  90.1  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0434511  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1175  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.852723  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1345  transcriptional regulator, LysR family  26.25 
 
 		 290 aa  89.7  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.515489  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1310  ndhF3 operon transcriptional regulator  24.91 
 
 		 323 aa  89.7  5e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2282  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 299 aa  89.7  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000573268  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.97 
 
 		 311 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2451  transcriptional regulator, LysR family  23.1 
 
 		 290 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.893513 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5280  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 297 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  26.34 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6941  transcriptional regulator, LysR family  24.66 
 
 		 298 aa  89.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1535  DNA-binding transcriptional regulator CynR  25.99 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1978  LysR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 296 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224272  normal  0.0418865 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  28.16 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2954  transcriptional regulator, LysR family  25.96 
 
 		 308 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000398128  unclonable  0.0000000375451 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4969  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5031  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.361143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>