More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2060 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2060  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2050  hypothetical protein  98.67 
 
 		 301 aa  614  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1760  hypothetical protein  48.97 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1760  hypothetical protein  48.62 
 
 		 302 aa  295  5e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0355  hypothetical protein  36.68 
 
 		 293 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0332  hypothetical protein  35.15 
 
 		 296 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1244  transcriptional regulator, LysR family  26.59 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1937  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0644  regulatory protein, LysR  24.25 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.72 
 
 		 300 aa  89.4  7e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02614  transcriptional regulator LysR family  24.63 
 
 		 296 aa  89  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2269  transcriptional regulator, LysR family  23.79 
 
 		 303 aa  87.4  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3464  LysR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1547  LysR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.240499 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00292  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.11 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3268  transcriptional regulator, LysR family  29.11 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2469  LysR family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.36421  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0362  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.11 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.709016  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00296  hypothetical protein  29.11 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0403  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.11 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2454  LysR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3454  LysR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3287  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.11 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2011  LysR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2937  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0387356  hitchhiker  0.00000808392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23730  LysR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0194065 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.92 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.356635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3425  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.92 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3775  LysR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2396  transcriptional regulator, LysR family  25.68 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02580  transcriptional regulator  20.28 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1515  LysR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2090  LysR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.115384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5606  DNA-binding transcriptional regulator CynR  26.03 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0369  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.69 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1027  LysR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174873 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1984  LysR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.958357  normal  0.045506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3323  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.51 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2464  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.51 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0411  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.69 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1720  transcriptional regulator, LysR family  23.34 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.820276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8034  transcriptional regulator, LysR family  24.9 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0383  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.51 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4207  LysR substrate-binding protein  28.41 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1243  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.51 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2454  lysR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1279  LysR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1912  transcriptional regulator, LysR family  24.18 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000315182  normal  0.0709139 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1902  LysR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2724  LysR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0713788  normal  0.0834627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  25 
 
 		 297 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2231  LysR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000245311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2180  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  27.8 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3462  DNA-binding transcriptional regulator CynR  29.92 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2244  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2552  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1443  LysR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2087  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.589785  normal  0.993199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2271  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.865675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2439  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2511  transcriptional regulator, LysR family  26.78 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4982  LysR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.960154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3094  DNA-binding transcriptional regulator CynR  25.9 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.899085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0036  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0161  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.68 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0644  DNA-binding transcriptional regulator CynR  28.68 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 297 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3084  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.115544  normal  0.0198492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34290  Transcriptional regualtor, LysR family  21.62 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1535  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.5 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.195582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8459  LysR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.983783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2455  transcriptional regulator, LysR family  24.32 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3199  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 332 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 295 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2533  transcriptional regulator, LysR family  24.32 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00448001  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3254  LysR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.819694  normal  0.147179 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2188  LysR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.540994  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3565  transcriptional regulator, LysR family  24.29 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167033  hitchhiker  0.00495072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5191  LysR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  22.79 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3924  transcriptional regulator, LysR family  21.72 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  24.59 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6344  LysR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.552099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1352  LysR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1735  LysR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 297 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2958  LysR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1779  hydrogen peroxide-inducible genes activator  25.2 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3730  DNA-binding transcriptional regulator CynR  27.47 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107166  normal  0.247106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>