48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2135 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2135  lipoprotein ABC transporter permease  100 
 
 		 314 aa  634    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.142253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  614  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 430 aa  614  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  81.31 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  80.66 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  50.49 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  40.33 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  39.2 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1167  ABC transporter, permease protein  36.72 
 
 		 430 aa  220  3e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  39.34 
 
 		 418 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0447  ABC transport permease protein  35.08 
 
 		 426 aa  209  5e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1514  permease domain protein  36.74 
 
 		 425 aa  206  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  36.18 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  38.69 
 
 		 408 aa  203  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  37.85 
 
 		 434 aa  203  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  35.28 
 
 		 429 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  35.28 
 
 		 429 aa  195  8.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  34.95 
 
 		 429 aa  193  4e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  33.23 
 
 		 444 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  26.56 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  25.66 
 
 		 379 aa  85.5  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  25.66 
 
 		 376 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  25.66 
 
 		 393 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  29.79 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  22.93 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.1 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1653  ABC transporter, permease protein  27.46 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  21.66 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1834  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  29.2 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2022  ABC transporter, permease protein  28.97 
 
 		 372 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0164828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  28.88 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 386 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  28.02 
 
 		 386 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  25.21 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  25.67 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1166  ABC transporter, permease protein  23.84 
 
 		 371 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  25.86 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0528  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.27 
 
 		 376 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.284767  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1251  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  19.78 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.430375  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0164  efflux ABC transporter, permease protein  22.87 
 
 		 455 aa  48.9  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  21.98 
 
 		 378 aa  46.6  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 		 462 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  21.99 
 
 		 373 aa  43.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  23.4 
 
 		 389 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>