88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0097 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0097  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  287  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0098  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  287  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4116  hypothetical protein  98.36 
 
 
122 aa  236  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0156  hypothetical protein  68.12 
 
 
140 aa  207  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0171  protein of unknown function DUF805  67.39 
 
 
140 aa  201  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4097  hypothetical protein  66.2 
 
 
146 aa  200  6e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4361  hypothetical protein  66.2 
 
 
146 aa  200  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.375451 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4455  hypothetical protein  66.2 
 
 
146 aa  200  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5376  hypothetical protein  66.2 
 
 
146 aa  200  6e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03755  hypothetical protein  66.2 
 
 
146 aa  200  6e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4064  protein of unknown function DUF805  66.2 
 
 
146 aa  200  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03806  conserved inner membrane protein  66.2 
 
 
146 aa  200  6e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4152  hypothetical protein  65.49 
 
 
146 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4482  putative inner membrane protein  68.79 
 
 
142 aa  196  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.877006  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4412  hypothetical protein  68.79 
 
 
142 aa  196  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.692782  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4299  hypothetical protein  68.31 
 
 
142 aa  196  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4414  hypothetical protein  68.79 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0644403  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4329  hypothetical protein  68.79 
 
 
142 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4803  hypothetical protein  75.18 
 
 
141 aa  192  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0105  protein of unknown function DUF805  64.54 
 
 
141 aa  187  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4401  hypothetical protein  68.22 
 
 
129 aa  184  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4050  hypothetical protein  62.32 
 
 
139 aa  178  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3806  protein of unknown function DUF805  63.91 
 
 
141 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001758  predicted membrane protein  32.19 
 
 
140 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531472  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0629  protein of unknown function DUF805  34.72 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2241  hypothetical protein  33.79 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0198  hypothetical protein  32.05 
 
 
179 aa  59.3  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0810  hypothetical protein  30.41 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0640  hypothetical protein  32.33 
 
 
386 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0666  hypothetical protein  34.15 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07330  hypothetical protein  34.15 
 
 
117 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  31.39 
 
 
1123 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00711  hypothetical protein  31.03 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1075  protein of unknown function DUF805  29.45 
 
 
221 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0445985  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2991  hypothetical protein  35.62 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0349732  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1666  protein of unknown function DUF805  30.53 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4744  hypothetical protein  29.71 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.595273  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0193  hypothetical protein  29.85 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0180  hypothetical protein  29.85 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122772  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06928  hypothetical protein  33.77 
 
 
123 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3123  protein of unknown function DUF805  27.54 
 
 
155 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0621474  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1263  hypothetical protein  44.12 
 
 
393 aa  47  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2214  protein of unknown function DUF805  30.37 
 
 
215 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3238  hypothetical protein  27.21 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3211  hypothetical protein  27.21 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3148  hypothetical protein  26.56 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.73067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1937  protein of unknown function DUF805  36.9 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.374907 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3491  hypothetical protein  27.21 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.396333  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0111  hypothetical protein  36.99 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482579  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3187  protein of unknown function DUF805  27.46 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.658779  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1149  hypothetical protein  28.37 
 
 
138 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02972  predicted inner membrane protein  31.06 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3258  putative inner membrane protein YhaH  31.06 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0598  protein of unknown function DUF805  31.06 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02923  hypothetical protein  31.06 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4418  putative inner membrane protein YhaH  31.06 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.147236 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3292  putative inner membrane protein YhaH  31.06 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3739  hypothetical protein  34.21 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.941569  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3401  putative inner membrane protein YhaH  31.06 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0593  hypothetical protein  31.06 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3577  putative inner membrane protein YhaH  31.06 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0278  hypothetical protein  30.61 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.951062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0126  hypothetical protein  31.71 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.845594 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1774  hypothetical protein  32.14 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0974139  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0992  hypothetical protein  31.43 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3606  hypothetical protein  31.51 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.758447  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1429  hypothetical protein  39.73 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1148  hypothetical protein  25 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3408  hypothetical protein  32.05 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2633  hypothetical protein  31.88 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.833808 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4038  hypothetical protein  31.34 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511833  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0838  hypothetical protein  29.11 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0311  hypothetical protein  31.51 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1014  cytochrome  29.55 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3579  putative inner membrane protein  26.98 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3905  hypothetical protein  40.48 
 
 
152 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.103527 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3254  putative inner membrane protein  26.98 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1104  protein of unknown function DUF805  34.52 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.280189  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4205  hypothetical protein  28.26 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3402  putative inner membrane protein  26.19 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02924  hypothetical protein  25.37 
 
 
118 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2599  protein of unknown function DUF805  38.57 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4419  putative inner membrane protein  25.37 
 
 
118 aa  40  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0841771 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0597  protein of unknown function DUF805  25.37 
 
 
118 aa  40  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3294  putative inner membrane protein  25.37 
 
 
118 aa  40  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02973  predicted inner membrane protein  25.37 
 
 
118 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0592  hypothetical protein  25.37 
 
 
118 aa  40  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0430  Sel1 domain protein repeat-containing protein  26.53 
 
 
230 aa  40  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>