More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1857 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1857  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 218 aa  447  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462262  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1751  riboflavin synthase subunit alpha  98.62 
 
 		 218 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2577  riboflavin synthase subunit alpha  99.08 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2190  riboflavin synthase subunit alpha  83.92 
 
 		 216 aa  354  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00893234  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2390  riboflavin synthase subunit alpha  79.33 
 
 		 211 aa  346  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2674  riboflavin synthase subunit alpha  80 
 
 		 211 aa  344  8e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1681  riboflavin synthase subunit alpha  76.78 
 
 		 216 aa  338  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.665855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01633  riboflavin synthase subunit alpha  79.51 
 
 		 213 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1978  riboflavin synthase, alpha subunit  79.51 
 
 		 213 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1535  riboflavin synthase subunit alpha  79.51 
 
 		 213 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0455024  hitchhiker  0.00124186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1742  riboflavin synthase subunit alpha  79.51 
 
 		 213 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1860  riboflavin synthase subunit alpha  79.51 
 
 		 213 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000205404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1876  riboflavin synthase subunit alpha  79.51 
 
 		 213 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1967  riboflavin synthase subunit alpha  79.51 
 
 		 213 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.756733  hitchhiker  0.00000222488 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2375  riboflavin synthase subunit alpha  79.51 
 
 		 213 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01623  hypothetical protein  79.51 
 
 		 213 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1713  riboflavin synthase subunit alpha  77.61 
 
 		 217 aa  333  9e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1784  riboflavin synthase subunit alpha  75 
 
 		 212 aa  333  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999549 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1748  riboflavin synthase subunit alpha  77.07 
 
 		 213 aa  327  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000886899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1522  riboflavin synthase subunit alpha  77.07 
 
 		 213 aa  327  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1917  riboflavin synthase subunit alpha  77.07 
 
 		 213 aa  327  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1536  riboflavin synthase subunit alpha  77.07 
 
 		 213 aa  327  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1559  riboflavin synthase subunit alpha  77.72 
 
 		 213 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2099  riboflavin synthase subunit alpha  66.34 
 
 		 204 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0812  riboflavin synthase subunit alpha  64.85 
 
 		 202 aa  275  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003523  lumazine protein  65.2 
 
 		 203 aa  269  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.942929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02237  riboflavin synthase subunit alpha  63.73 
 
 		 203 aa  268  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0087  riboflavin synthase subunit alpha  61 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0316788  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1383  riboflavin synthase subunit alpha  58.62 
 
 		 203 aa  244  9e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1940  riboflavin synthase subunit alpha  56.93 
 
 		 205 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1762  riboflavin synthase subunit alpha  53.2 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117708  normal  0.0239338 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2267  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00496217  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  52.48 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 		 206 aa  201  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  51.49 
 
 		 209 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 207 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 207 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 207 aa  198  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 207 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2495  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634088  hitchhiker  0.00287874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2030  riboflavin synthase subunit alpha  47.8 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2118  riboflavin synthase subunit alpha  51.46 
 
 		 210 aa  194  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.0673441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2036  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357361  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1703  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 204 aa  192  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.043412  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8148  predicted protein  51.6 
 
 		 188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.564807  normal  0.0620362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2867  riboflavin synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.999273 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2916  riboflavin synthase subunit alpha  44.23 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1243  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2775  riboflavin synthase subunit alpha  44.23 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2113  riboflavin synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 235 aa  169  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1865  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2115  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.757101  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3429  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4077  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 238 aa  165  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.578538 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3729  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 		 237 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  0.402908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4568  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 		 237 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3795  riboflavin synthase subunit alpha  45.5 
 
 		 237 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5723  riboflavin synthase subunit alpha  43.63 
 
 		 234 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5522  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189133  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3686  riboflavin synthase subunit alpha  44.59 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0704066  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4731  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2300  riboflavin synthase subunit alpha  43.69 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.745499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4434  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563917  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  40.85 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  40.98 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 219 aa  144  9e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  41.94 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  38.92 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  41.58 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  40.2 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  40.69 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 213 aa  141  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  42.16 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  40.58 
 
 		 202 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  40.98 
 
 		 198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  40.87 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  41.49 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 		 220 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  41.49 
 
 		 217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  40.84 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  39.32 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  43.09 
 
 		 218 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  35.94 
 
 		 218 aa  135  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 251 aa  134  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  41.58 
 
 		 200 aa  134  9e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  38.17 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  38.17 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  40.96 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3144  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  38.83 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>