More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCI_0087 on replicon NC_007984
Organism: Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007984  BCI_0087  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0316788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1536  riboflavin synthase subunit alpha  63.68 
 
 
213 aa  268  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01633  riboflavin synthase subunit alpha  65.5 
 
 
213 aa  268  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1978  riboflavin synthase, alpha subunit  65.5 
 
 
213 aa  268  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209039  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1559  riboflavin synthase subunit alpha  63.68 
 
 
213 aa  268  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1535  riboflavin synthase subunit alpha  65.5 
 
 
213 aa  268  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0455024  hitchhiker  0.00124186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2375  riboflavin synthase subunit alpha  65.5 
 
 
213 aa  268  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1742  riboflavin synthase subunit alpha  65.5 
 
 
213 aa  268  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1860  riboflavin synthase subunit alpha  65.5 
 
 
213 aa  268  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000205404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1876  riboflavin synthase subunit alpha  65.5 
 
 
213 aa  268  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224926  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01623  hypothetical protein  65.5 
 
 
213 aa  268  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1967  riboflavin synthase subunit alpha  65.5 
 
 
213 aa  268  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.756733  hitchhiker  0.00000222488 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1748  riboflavin synthase subunit alpha  63.5 
 
 
213 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000886899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1522  riboflavin synthase subunit alpha  63.5 
 
 
213 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1917  riboflavin synthase subunit alpha  63.5 
 
 
213 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2674  riboflavin synthase subunit alpha  62.19 
 
 
211 aa  264  8e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2390  riboflavin synthase subunit alpha  61.69 
 
 
211 aa  264  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1681  riboflavin synthase subunit alpha  62 
 
 
216 aa  263  1e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.665855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1784  riboflavin synthase subunit alpha  63.5 
 
 
212 aa  262  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2190  riboflavin synthase subunit alpha  62.31 
 
 
216 aa  260  8e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00893234  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1713  riboflavin synthase subunit alpha  58.42 
 
 
217 aa  258  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1751  riboflavin synthase subunit alpha  61 
 
 
218 aa  254  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1857  riboflavin synthase subunit alpha  61 
 
 
218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2577  riboflavin synthase subunit alpha  61 
 
 
218 aa  253  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0812  riboflavin synthase subunit alpha  56 
 
 
202 aa  226  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2099  riboflavin synthase subunit alpha  49.51 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003523  lumazine protein  54.23 
 
 
203 aa  216  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.942929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02237  riboflavin synthase subunit alpha  51.74 
 
 
203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1762  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 
202 aa  186  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117708  normal  0.0239338 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1940  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 
205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2118  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 
210 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.0673441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2267  riboflavin synthase subunit alpha  45.81 
 
 
205 aa  179  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00496217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2495  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 
204 aa  178  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634088  hitchhiker  0.00287874 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1383  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 
203 aa  177  8e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1703  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 
204 aa  177  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.043412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2030  riboflavin synthase subunit alpha  46.5 
 
 
204 aa  177  8e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2036  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 
203 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357361  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 
207 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 
206 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 
206 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 
206 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 
207 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 
207 aa  174  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  45.81 
 
 
206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 
209 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8148  predicted protein  44.68 
 
 
188 aa  161  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.564807  normal  0.0620362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2867  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 
209 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.999273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2775  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 
209 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2916  riboflavin synthase subunit alpha  38.58 
 
 
209 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619819  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2113  riboflavin synthase subunit alpha  39.41 
 
 
235 aa  152  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3429  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
238 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2115  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 
205 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.757101  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4077  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
238 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.578538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1243  riboflavin synthase, alpha subunit  38.61 
 
 
210 aa  147  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4731  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 
235 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5723  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 
234 aa  141  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1865  riboflavin synthase subunit alpha  36.95 
 
 
218 aa  141  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4434  riboflavin synthase subunit alpha  39.2 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563917  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3686  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0704066  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5522  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 
237 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189133  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2300  riboflavin synthase subunit alpha  37.13 
 
 
237 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.745499  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3729  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 
237 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  0.402908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4568  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 
237 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3795  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 
237 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  40.91 
 
 
215 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  40.86 
 
 
215 aa  134  7.000000000000001e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 
217 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 
217 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  39.81 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  39.46 
 
 
193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  36.22 
 
 
217 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  37.81 
 
 
203 aa  128  6e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  34.59 
 
 
199 aa  128  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  39.15 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  35.83 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  34.22 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  35.94 
 
 
251 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  37.84 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  37.3 
 
 
216 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  37.76 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  34.59 
 
 
202 aa  125  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  36.65 
 
 
205 aa  125  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  38.62 
 
 
214 aa  124  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  34.76 
 
 
221 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 
196 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  35.48 
 
 
218 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  35.14 
 
 
217 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.84 
 
 
210 aa  122  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  32.52 
 
 
201 aa  122  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  35.14 
 
 
217 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  35.75 
 
 
207 aa  122  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  37.84 
 
 
218 aa  121  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  38.97 
 
 
210 aa  121  8e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.25 
 
 
217 aa  121  8e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  35.35 
 
 
198 aa  121  9e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 
218 aa  121  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.71 
 
 
214 aa  121  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  35.64 
 
 
204 aa  120  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  36.76 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>