More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2495 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2495  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634088  hitchhiker  0.00287874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2118  riboflavin synthase subunit alpha  91.09 
 
 		 210 aa  374  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.0673441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2036  riboflavin synthase subunit alpha  82.59 
 
 		 203 aa  347  9e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357361  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  81.59 
 
 		 206 aa  342  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  81.59 
 
 		 206 aa  342  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  81.59 
 
 		 206 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2267  riboflavin synthase subunit alpha  81.59 
 
 		 205 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00496217  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  79.6 
 
 		 209 aa  335  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  79.31 
 
 		 206 aa  334  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  76.35 
 
 		 207 aa  330  6e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  76.35 
 
 		 207 aa  330  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  76.35 
 
 		 207 aa  329  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  75.37 
 
 		 207 aa  324  6e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2030  riboflavin synthase subunit alpha  71.64 
 
 		 204 aa  308  4e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1703  riboflavin synthase subunit alpha  68.81 
 
 		 204 aa  297  7e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.043412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1762  riboflavin synthase subunit alpha  67.16 
 
 		 202 aa  280  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117708  normal  0.0239338 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1559  riboflavin synthase subunit alpha  54.63 
 
 		 213 aa  218  6e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1522  riboflavin synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 213 aa  217  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1917  riboflavin synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 213 aa  217  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1748  riboflavin synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 213 aa  217  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000886899  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1536  riboflavin synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 213 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1681  riboflavin synthase subunit alpha  53.43 
 
 		 216 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.665855  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01633  riboflavin synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1978  riboflavin synthase, alpha subunit  54.9 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209039  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1967  riboflavin synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.756733  hitchhiker  0.00000222488 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1860  riboflavin synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000205404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1535  riboflavin synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0455024  hitchhiker  0.00124186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2375  riboflavin synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1742  riboflavin synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01623  hypothetical protein  54.9 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1876  riboflavin synthase subunit alpha  54.9 
 
 		 213 aa  215  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1784  riboflavin synthase subunit alpha  54.46 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2390  riboflavin synthase subunit alpha  54.46 
 
 		 211 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2674  riboflavin synthase subunit alpha  54.46 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1713  riboflavin synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 217 aa  208  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02237  riboflavin synthase subunit alpha  52.74 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1383  riboflavin synthase subunit alpha  51.72 
 
 		 203 aa  200  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2190  riboflavin synthase subunit alpha  52.26 
 
 		 216 aa  199  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00893234  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003523  lumazine protein  50.75 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.942929  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1751  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 218 aa  198  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1857  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2577  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0812  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 202 aa  194  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1940  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 205 aa  190  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2867  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 209 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.999273 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0087  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0316788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2916  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2099  riboflavin synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 204 aa  175  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2775  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2115  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.757101  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2113  riboflavin synthase subunit alpha  45.1 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1865  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4731  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 235 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5723  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 234 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1243  riboflavin synthase, alpha subunit  43.27 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3429  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 238 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4077  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.578538 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4434  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 237 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563917  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3144  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8148  predicted protein  43.62 
 
 		 188 aa  145  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.564807  normal  0.0620362 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3686  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0704066  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5522  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189133  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3729  riboflavin synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 237 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  0.402908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4568  riboflavin synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 237 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3795  riboflavin synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 237 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2300  riboflavin synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 237 aa  140  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.745499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 199 aa  134  9e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  38.24 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  42.7 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  40.32 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 198 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  38.31 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  38.73 
 
 		 198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  37.81 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  35.82 
 
 		 214 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  39.15 
 
 		 203 aa  124  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  36.96 
 
 		 213 aa  124  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  38.17 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  38.17 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  35.87 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  40.22 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  35.47 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  38.21 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  39.13 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  36.59 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  36.68 
 
 		 217 aa  121  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  37.5 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.21 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 		 219 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  39.67 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  36.41 
 
 		 213 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1181  riboflavin synthase subunit alpha  35.2 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1187  riboflavin synthase subunit alpha  35.2 
 
 		 204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  36.41 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0657  riboflavin synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0761  riboflavin synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>