More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3144 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3144  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 236 aa  478  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5723  riboflavin synthase subunit alpha  60.78 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4731  riboflavin synthase subunit alpha  57.87 
 
 		 235 aa  290  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4077  riboflavin synthase subunit alpha  58.7 
 
 		 238 aa  287  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.578538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3429  riboflavin synthase subunit alpha  58.7 
 
 		 238 aa  286  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2113  riboflavin synthase subunit alpha  57.94 
 
 		 235 aa  275  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2300  riboflavin synthase subunit alpha  57.08 
 
 		 237 aa  266  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.745499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5522  riboflavin synthase subunit alpha  57.96 
 
 		 237 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189133  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4568  riboflavin synthase subunit alpha  57.52 
 
 		 237 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3795  riboflavin synthase subunit alpha  57.52 
 
 		 237 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3729  riboflavin synthase subunit alpha  57.52 
 
 		 237 aa  263  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  0.402908 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3686  riboflavin synthase subunit alpha  57.52 
 
 		 237 aa  263  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0704066  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4434  riboflavin synthase subunit alpha  56.11 
 
 		 237 aa  249  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563917  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1940  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 205 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1243  riboflavin synthase, alpha subunit  42.99 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 206 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 207 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 206 aa  158  8e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 206 aa  158  8e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003523  lumazine protein  42.79 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.942929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02237  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 203 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  41.79 
 
 		 207 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1703  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 204 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.043412  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 206 aa  155  8e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1713  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2267  riboflavin synthase subunit alpha  42.29 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00496217  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2030  riboflavin synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1865  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2036  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 203 aa  151  7e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357361  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1762  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117708  normal  0.0239338 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0812  riboflavin synthase subunit alpha  45.05 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2115  riboflavin synthase subunit alpha  39.81 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.757101  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2916  riboflavin synthase subunit alpha  38.68 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2775  riboflavin synthase subunit alpha  38.68 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2118  riboflavin synthase subunit alpha  40.58 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.0673441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2495  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 204 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634088  hitchhiker  0.00287874 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2674  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1784  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 212 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2867  riboflavin synthase subunit alpha  37.86 
 
 		 209 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.999273 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2390  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2190  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00893234  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1383  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01633  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1978  riboflavin synthase, alpha subunit  41.09 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1860  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000205404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1742  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343227  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1535  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0455024  hitchhiker  0.00124186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01623  hypothetical protein  41.09 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2375  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1876  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224926  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1967  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.756733  hitchhiker  0.00000222488 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1681  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.665855  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8148  predicted protein  41.8 
 
 		 188 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.564807  normal  0.0620362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2099  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1522  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1917  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1536  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1748  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000886899  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1559  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 213 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1857  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2577  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1751  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311618  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0087  riboflavin synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 207 aa  116  3e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0316788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  36.17 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  36.17 
 
 		 196 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  36.41 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  35.79 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04231  riboflavin synthase, alpha subunit (AFU_orthologue; AFUA_1G06240)  32.89 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.126635  normal  0.37448 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  34.2 
 
 		 201 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  37.04 
 
 		 200 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  36.04 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  32.99 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  32.99 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  36.17 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  33.86 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  33.86 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  36.22 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  33.86 
 
 		 203 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  35.9 
 
 		 203 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  35.05 
 
 		 204 aa  105  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  33.16 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  35.79 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  36.46 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  35.23 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  34.87 
 
 		 207 aa  103  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  34.87 
 
 		 203 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  34.21 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  34.02 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  33.16 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  32.62 
 
 		 205 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  33.16 
 
 		 220 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  35.9 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  33.69 
 
 		 214 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  35.03 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  34.55 
 
 		 200 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  33.51 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>