159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1383 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1383  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
277 aa  545  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226769  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1033  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.127131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
270 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
270 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  28.9 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  28.9 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1900  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.99 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  27 
 
 
265 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
264 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 
333 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.72 
 
 
264 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 
262 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
287 aa  62  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1653  alpha/beta hydrolase fold  29.06 
 
 
274 aa  59.3  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0637812  hitchhiker  0.00860523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  24.8 
 
 
273 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.14 
 
 
286 aa  59.3  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
295 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
261 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  26.95 
 
 
279 aa  55.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  37.86 
 
 
273 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  24.11 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1287  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00130508  normal  0.0205637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  25.97 
 
 
279 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  26.46 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 
290 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.78 
 
 
299 aa  53.1  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  30.34 
 
 
251 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  25.1 
 
 
264 aa  52.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  23.77 
 
 
323 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  28.14 
 
 
263 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  24.61 
 
 
298 aa  52  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
291 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1572  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
281 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2868  alpha/beta hydrolase fold protein  35.11 
 
 
265 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0147271  normal  0.0470272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
287 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  26.42 
 
 
262 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  23.79 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
289 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
309 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
314 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.86 
 
 
339 aa  50.4  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3496  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 
267 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.094698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  26.77 
 
 
263 aa  50.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
287 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  27.89 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
263 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0934  alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.570173  hitchhiker  0.00160688 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.07 
 
 
323 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2178  hydrolase, putative  33.63 
 
 
233 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
268 aa  49.3  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3733  magnesium chelatase accessory protein  28.09 
 
 
293 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.229293  normal  0.0818214 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2642  alpha/beta hydrolase fold protein  25.62 
 
 
288 aa  49.3  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.554493  normal  0.31164 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
291 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
291 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
291 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  26.79 
 
 
264 aa  48.9  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.96 
 
 
321 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  24.63 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2090  putative hydrolase  32.74 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  23.46 
 
 
265 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05110  expressed protein  33.04 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0084  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  24.39 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.71 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 
261 aa  47.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  30.05 
 
 
288 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  31.96 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3829  bioH protein  26.27 
 
 
259 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3585  alpha/beta hydrolase fold  26.11 
 
 
270 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  25.61 
 
 
425 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 
351 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  25.71 
 
 
275 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2832  3-oxoadipate enol-lactonase  26.91 
 
 
393 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.448984  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.54 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  22.89 
 
 
270 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  28.18 
 
 
310 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
363 aa  46.6  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2054  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
260 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.198896 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  25.48 
 
 
268 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.34 
 
 
282 aa  46.2  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  25.42 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  35.14 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  25.09 
 
 
462 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 
268 aa  45.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6152  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
293 aa  46.2  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>