272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6152 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6152  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 293 aa  570  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5899  alpha/beta hydrolase fold protein  67.94 
 
 		 294 aa  364  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5883  alpha/beta hydrolase fold protein  63.08 
 
 		 293 aa  341  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2841  putative hydrolase  32.71 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2285  putative hydrolase  32.6 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.45293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0889  lipolytic enzyme  26.2 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  32.95 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  38.94 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  42.24 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  35.07 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  39.82 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  28.57 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.89 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7821  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  33.63 
 
 		 311 aa  55.8  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  30.26 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2615  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.989556  normal  0.03074 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.2 
 
 		 350 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3962  3-oxoadipate enol-lactonase  23.22 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  24.62 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  36.84 
 
 		 254 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  28.75 
 
 		 332 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  36.61 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 		 323 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  23.85 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  35.85 
 
 		 260 aa  53.5  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  35.77 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  39.53 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  27.15 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  35.96 
 
 		 323 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 308 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  23.61 
 
 		 296 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  41.18 
 
 		 396 aa  52.8  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  33.04 
 
 		 301 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  28.85 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.41 
 
 		 263 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  28.46 
 
 		 256 aa  52.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  37.04 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2642  Alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2382  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  23.44 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  38.6 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3529  3-oxoadipate enol-lactonase  22.15 
 
 		 294 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  36.7 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  31.86 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  28.24 
 
 		 390 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1595  alpha/beta hydrolase fold  22.75 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.649162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  32.74 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 298 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  30.28 
 
 		 387 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  34.48 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  30.59 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  27.07 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 		 310 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2132  hypothetical protein  29.91 
 
 		 247 aa  50.1  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2437  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8394  putative hydrolase  27.2 
 
 		 290 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  22.75 
 
 		 252 aa  49.7  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7676  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 		 269 aa  49.7  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 354 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  33.33 
 
 		 350 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  28.07 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  45.45 
 
 		 270 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 274 aa  49.3  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  22.39 
 
 		 264 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.66 
 
 		 236 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  38.79 
 
 		 292 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  35 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2514  alpha/beta hydrolase fold protein  36.27 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 		 341 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  35.34 
 
 		 292 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  28.69 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.08 
 
 		 268 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22060  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.56 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00549421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>