More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5883 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5883  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5899  alpha/beta hydrolase fold protein  77.11 
 
 		 294 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6152  alpha/beta hydrolase fold protein  65.89 
 
 		 293 aa  337  9.999999999999999e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2841  putative hydrolase  31.98 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2285  putative hydrolase  31.98 
 
 		 300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.45293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 308 aa  73.9  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  38.33 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0337  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  25.79 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00660  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  30.25 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.41 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  33.03 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  34.21 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0544  hypothetical protein  30.08 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00193081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  26.83 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0700  hypothetical protein  30.08 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000140392  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  33.91 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  32.93 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  40.59 
 
 		 309 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  23.33 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  26.02 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  26.02 
 
 		 296 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0653  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.748775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29020  chloroperoxidase precursor  24.38 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.995557  hitchhiker  0.000198264 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0638  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5750  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0874  alpha/beta hydrolase fold protein  22.71 
 
 		 301 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  25.93 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  29.44 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  33.04 
 
 		 254 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 		 285 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.13 
 
 		 264 aa  53.5  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1360  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.266873  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0723  alpha/beta hydrolase fold protein  43.59 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2172  Alpha/beta hydrolase fold  24.78 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  31.5 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1286  chloride peroxidase  25.65 
 
 		 274 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.52779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1303  chloride peroxidase  25.65 
 
 		 274 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199298  normal  0.019602 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  27.45 
 
 		 387 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5684  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6048  alpha/beta hydrolase fold  28.45 
 
 		 276 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.850826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  26.1 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 336 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 		 308 aa  52.4  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0531  alpha/beta hydrolase fold  37.93 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0176995 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 336 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  32.52 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  32.54 
 
 		 324 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1520  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  26.47 
 
 		 262 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  34.96 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0343  alpha/beta fold family hydrolase  28.76 
 
 		 372 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  25.42 
 
 		 308 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  30.16 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1700  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.148356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  32.56 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1199  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.81 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1573  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  32.23 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.3 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  31.09 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1315  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.991982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  28.41 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  25.38 
 
 		 265 aa  50.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2264  alpha/beta hydrolase fold protein  31.86 
 
 		 290 aa  50.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426899  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  36.22 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0128  Chloride peroxidase  30.67 
 
 		 275 aa  50.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00372982  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3036  alpha/beta hydrolase fold protein  33.83 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  38.46 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7479  Alpha/beta hydrolase  25.74 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4013  alpha/beta hydrolase fold protein  26.25 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 290 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4969  Alpha/beta hydrolase  26.15 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0107972 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 		 281 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 		 332 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 		 305 aa  49.3  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>