More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1246 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1246  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.177506  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2444  extracellular solute-binding protein family 3  67.57 
 
 		 294 aa  388  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.474573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15430  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  67.78 
 
 		 297 aa  325  5e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0169266  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1593  extracellular solute-binding protein family 3  60.42 
 
 		 278 aa  322  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22730  amino acid-binding protein  66.95 
 
 		 290 aa  322  6e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.718318  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  58.57 
 
 		 279 aa  318  9e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  53.28 
 
 		 277 aa  295  8e-79  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  50.88 
 
 		 282 aa  276  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0671  extracellular solute-binding protein family 3  50.69 
 
 		 283 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159271  normal  0.167572 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0809  extracellular solute-binding protein  53.6 
 
 		 285 aa  241  7e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1470  extracellular solute-binding protein family 3  48.23 
 
 		 274 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.506058  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  56.97 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  56.97 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  56.97 
 
 		 275 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2427  extracellular solute-binding protein  55.37 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.45539  normal  0.110976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3988  extracellular solute-binding protein family 3  55.28 
 
 		 321 aa  228  8e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3969  extracellular solute-binding protein  54.69 
 
 		 279 aa  226  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.62818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3287  extracellular solute-binding protein family 3  48.22 
 
 		 290 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00463903  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  49.8 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0186  extracellular solute-binding protein family 3  47.6 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4400  extracellular solute-binding protein family 3  46.69 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  43.43 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  49.12 
 
 		 295 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2222  glutamine ABC transporter (glutamine-binding protein)  43.18 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  41.64 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3913  extracellular solute-binding protein family 3  47.06 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1790  extracellular solute-binding protein family 3  42.51 
 
 		 323 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  43.18 
 
 		 275 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07790  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  40.43 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27710  amino acid-binding protein  47.32 
 
 		 304 aa  188  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.620875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  44.8 
 
 		 323 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3520  extracellular solute-binding protein  45.25 
 
 		 296 aa  182  6e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1430  extracellular solute-binding protein  43.69 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2206  extracellular solute-binding protein family 3  41.6 
 
 		 355 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2522  extracellular solute-binding protein family 3  42.79 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000888885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36870  amino acid-binding protein  42.99 
 
 		 290 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  42.79 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1394  extracellular solute-binding protein  41.7 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  36.07 
 
 		 281 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  35.53 
 
 		 286 aa  135  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  35.4 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3984  extracellular solute-binding protein family 3  34.08 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  37.33 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7045  Serine/threonine protein kinase-like protein  34.41 
 
 		 600 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.200024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0327  amino acid ABC transporter/signal transduction systems periplasmic protein  32.75 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.503562  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30080  amino acid-binding protein  40.29 
 
 		 324 aa  125  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37210  periplasmic component of amino acid ABC-type transporter/signal transduction system  34.58 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.734714  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1256  Serine/threonine protein kinase-like protein  33.92 
 
 		 751 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.4 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  36.4 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  36.4 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.4 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  36.32 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  36.4 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  36.4 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.96 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  36.87 
 
 		 318 aa  119  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.96 
 
 		 276 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  35.53 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  33.48 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  33.73 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3756  extracellular solute-binding protein  36.36 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  33.84 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  35.66 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  33.45 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3298  extracellular solute-binding protein  32.85 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 332 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 		 324 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6294  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 305 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102459  normal  0.206297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10416  glutamine-binding lipoprotein glnH  32.89 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000397853  normal  0.816893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 319 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  30.5 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0531  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 331 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3754  extracellular solute-binding protein family 3  31.7 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.807307  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0541  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 331 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0553  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 		 331 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.104829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1121  extracellular solute-binding protein family 3  33.6 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.591856  normal  0.275359 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2367  extracellular solute-binding protein family 3  34.42 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3045  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.29813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4553  extracellular solute-binding protein family 3  32.61 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.284886 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  34.62 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1093  extracellular solute-binding protein family 3  34.29 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.019092 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1487  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.81 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3158  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.81 
 
 		 250 aa  99.8  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0137955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3538  extracellular solute-binding protein family 3  35.06 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.139561  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3272  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.81 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  27.86 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1961  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.52 
 
 		 250 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0205  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2098  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.33 
 
 		 250 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.230871  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1406  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.33 
 
 		 250 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2391  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.33 
 
 		 250 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  31.02 
 
 		 318 aa  99  9e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1126  glutamine ABC transporter periplasmic protein  29.33 
 
 		 250 aa  99  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0348  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0467  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.79 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  28.46 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>