98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0136 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  100 
 
 
382 aa  762    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  61.54 
 
 
303 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  66.81 
 
 
389 aa  299  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  65.28 
 
 
211 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  59.77 
 
 
268 aa  271  1e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  66.15 
 
 
250 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  67.96 
 
 
208 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  67.39 
 
 
273 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  52.6 
 
 
461 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  62.56 
 
 
249 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  62.57 
 
 
244 aa  252  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  58.94 
 
 
240 aa  243  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  64.52 
 
 
239 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  66.28 
 
 
291 aa  239  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  59.16 
 
 
208 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  60.75 
 
 
222 aa  234  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  51.84 
 
 
306 aa  225  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  54.79 
 
 
291 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  52.05 
 
 
265 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  55.67 
 
 
252 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  50.77 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  48.21 
 
 
236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  51.11 
 
 
252 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  50 
 
 
220 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  44.78 
 
 
239 aa  163  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  46.7 
 
 
231 aa  159  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  44.79 
 
 
237 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  44.44 
 
 
243 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  42.5 
 
 
235 aa  149  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  44.27 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  44.27 
 
 
236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  47.5 
 
 
250 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  42.92 
 
 
279 aa  147  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  44.27 
 
 
236 aa  146  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  39.64 
 
 
236 aa  142  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  45.4 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  42.02 
 
 
215 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  38.17 
 
 
212 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  40.34 
 
 
202 aa  116  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  38.96 
 
 
242 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  38.25 
 
 
228 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  30.67 
 
 
272 aa  109  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  37.23 
 
 
211 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  31.03 
 
 
249 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  37.43 
 
 
212 aa  105  9e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  35.88 
 
 
219 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  34.03 
 
 
214 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  34.55 
 
 
235 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  38.33 
 
 
211 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  31.66 
 
 
226 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  38.42 
 
 
220 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  34.25 
 
 
220 aa  99.4  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  32.39 
 
 
219 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  41.06 
 
 
230 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  41.06 
 
 
230 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  37.41 
 
 
199 aa  89.7  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  30.07 
 
 
197 aa  84  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  33.95 
 
 
204 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  37.07 
 
 
170 aa  75.1  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  29.44 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  32.62 
 
 
231 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  72.5 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  65.31 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  64.86 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  59.09 
 
 
219 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  60.78 
 
 
138 aa  59.7  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  64.86 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  64.86 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  64.86 
 
 
333 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  64.86 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  64.86 
 
 
333 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  64.86 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  64.86 
 
 
287 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  72.09 
 
 
115 aa  58.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  65.31 
 
 
220 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  57.5 
 
 
287 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  62.16 
 
 
330 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  55 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  61.54 
 
 
211 aa  53.1  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2148  hypothetical protein  84.62 
 
 
161 aa  50.1  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  52.63 
 
 
77 aa  49.7  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  51.35 
 
 
625 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  55.26 
 
 
233 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  75.68 
 
 
154 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0302  Excalibur domain protein  67.57 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  72.97 
 
 
156 aa  47.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  55.56 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  42.19 
 
 
257 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  44.23 
 
 
266 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  45.1 
 
 
268 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  45.1 
 
 
268 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2181  Excalibur domain-containing protein  62.16 
 
 
211 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  62.16 
 
 
232 aa  43.5  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  52.78 
 
 
272 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  42.59 
 
 
276 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12140  putative calcium-binding protein  52.78 
 
 
156 aa  43.1  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00153272  normal  0.0976113 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  40.62 
 
 
272 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  40.62 
 
 
272 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>