16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12140 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_12140  putative calcium-binding protein  100 
 
 
156 aa  303  5.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00153272  normal  0.0976113 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  57.14 
 
 
257 aa  60.5  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  63.89 
 
 
272 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  63.89 
 
 
268 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  63.89 
 
 
268 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  63.89 
 
 
272 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  63.89 
 
 
272 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  63.89 
 
 
276 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0880  Excalibur domain protein  40.58 
 
 
74 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  54.76 
 
 
266 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  61.11 
 
 
272 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  38.64 
 
 
219 aa  42.4  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  52.78 
 
 
382 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3889  Excalibur domain-containing protein  35.38 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.365295  normal  0.184379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
349 aa  41.2  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  43.18 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>