61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2741 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  615  1e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  60.73 
 
 
208 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  55.05 
 
 
250 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  58.97 
 
 
382 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  58.25 
 
 
273 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  59.07 
 
 
303 aa  222  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  54.59 
 
 
244 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  52.5 
 
 
389 aa  219  6e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  55.72 
 
 
461 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  58.42 
 
 
268 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  59.14 
 
 
249 aa  211  2e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  55.73 
 
 
211 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  53.92 
 
 
222 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  56.32 
 
 
240 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  57.14 
 
 
239 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  51.81 
 
 
247 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  46.89 
 
 
236 aa  194  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  52.69 
 
 
208 aa  193  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  56.47 
 
 
265 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  54.69 
 
 
252 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  51.85 
 
 
291 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  54.97 
 
 
291 aa  179  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  47.76 
 
 
236 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  47.76 
 
 
236 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  47.76 
 
 
236 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  46.53 
 
 
236 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  45.41 
 
 
237 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  48.31 
 
 
235 aa  158  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  48.52 
 
 
231 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  46.67 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  44.68 
 
 
239 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  41.9 
 
 
220 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  42.7 
 
 
279 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  43.86 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  47.31 
 
 
250 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  47.31 
 
 
250 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  37.98 
 
 
215 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  33.95 
 
 
220 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  33.85 
 
 
219 aa  103  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  35.38 
 
 
249 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
202 aa  100  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  38.25 
 
 
211 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  34.16 
 
 
214 aa  95.9  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  35.6 
 
 
212 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  32.18 
 
 
219 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  35.82 
 
 
228 aa  92.8  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  36.27 
 
 
230 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  36.27 
 
 
230 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  36.95 
 
 
211 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  31.29 
 
 
272 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  33.54 
 
 
242 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  32.09 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  30.21 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  34.41 
 
 
235 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  33.77 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  33.33 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  31.35 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  33.7 
 
 
199 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  29.94 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  35.29 
 
 
231 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  36.44 
 
 
170 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>