61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5967 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  100 
 
 
226 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  54.35 
 
 
219 aa  205  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  52.49 
 
 
212 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  47.98 
 
 
228 aa  168  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  47.59 
 
 
212 aa  164  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  46.77 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  46.37 
 
 
211 aa  154  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  36.32 
 
 
256 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  39.44 
 
 
215 aa  146  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  41.54 
 
 
214 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  47.47 
 
 
235 aa  141  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  37.44 
 
 
219 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  40.56 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  43.86 
 
 
211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  40.28 
 
 
197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  36.74 
 
 
220 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  38.46 
 
 
242 aa  118  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  41.25 
 
 
220 aa  118  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  36.31 
 
 
273 aa  108  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  36.08 
 
 
249 aa  104  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  31.66 
 
 
382 aa  102  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  32.54 
 
 
252 aa  101  8e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  32.98 
 
 
250 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  33.15 
 
 
208 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  32.08 
 
 
204 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  33.99 
 
 
247 aa  94.7  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  29.95 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  31.72 
 
 
222 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  30.37 
 
 
211 aa  91.7  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  30.25 
 
 
272 aa  90.5  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  36.09 
 
 
291 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  33.16 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  31.72 
 
 
236 aa  89.4  4e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  44 
 
 
235 aa  89  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  31.35 
 
 
240 aa  88.6  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  43 
 
 
236 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  30.56 
 
 
291 aa  87.8  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  29.82 
 
 
265 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  32.94 
 
 
239 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  29.41 
 
 
231 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  33.88 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  35.67 
 
 
268 aa  86.3  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  34.36 
 
 
220 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  41 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  41 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  41 
 
 
236 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  30.21 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  31.41 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  28.64 
 
 
461 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  32.53 
 
 
279 aa  83.6  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  32.73 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  31.79 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  31.49 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  40.4 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  30.09 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  33.13 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  31.49 
 
 
250 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  39.78 
 
 
231 aa  72.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  38.71 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  29.01 
 
 
230 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  29.01 
 
 
230 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.671648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>