82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0048 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  100 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  66.39 
 
 		 303 aa  309  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  59.77 
 
 		 382 aa  293  3e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  64.11 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  66.15 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  68.16 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  66.3 
 
 		 461 aa  253  3e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  68.36 
 
 		 211 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  64.95 
 
 		 208 aa  251  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  65.93 
 
 		 239 aa  241  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  68.6 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  63.69 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  62.36 
 
 		 222 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  58.1 
 
 		 244 aa  228  9e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  57.59 
 
 		 240 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  57.21 
 
 		 306 aa  218  6e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  51.66 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  57.14 
 
 		 208 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  52.07 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  50.26 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  47.64 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  47.73 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  53.37 
 
 		 252 aa  176  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  45.66 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  47.54 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  44.78 
 
 		 231 aa  158  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  45 
 
 		 220 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  46.67 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  46.67 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  46.67 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  44.71 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  46.34 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  42.22 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  44.51 
 
 		 279 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  46.95 
 
 		 250 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  43.17 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  41.44 
 
 		 215 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  38.21 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  35.75 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  39.66 
 
 		 212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  32.59 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  38.67 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  39.08 
 
 		 220 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  35.19 
 
 		 220 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  35.88 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  35.76 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  34.16 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  37.99 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  36.67 
 
 		 211 aa  99.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  34.83 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  42.38 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  42.38 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  36.31 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  35.07 
 
 		 226 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  39.44 
 
 		 228 aa  92  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  34.39 
 
 		 212 aa  87.8  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  37.39 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  32.57 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  39.83 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  32.53 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  35.96 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  58.82 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  56.1 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  56.1 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  56.1 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  56.1 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  56.1 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  56.1 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  56.1 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  62.79 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  55.1 
 
 		 138 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  53.66 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  62.5 
 
 		 351 aa  53.9  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  54.17 
 
 		 330 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  50 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  56.76 
 
 		 77 aa  48.9  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2148  hypothetical protein  80.77 
 
 		 161 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  72.22 
 
 		 115 aa  46.2  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  41.46 
 
 		 334 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  56.25 
 
 		 220 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 625 aa  42.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  61.9 
 
 		 154 aa  42.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>