63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2568 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  506  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  48.18 
 
 
272 aa  214  8e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  46.67 
 
 
170 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  40.96 
 
 
231 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  41.34 
 
 
199 aa  154  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  47.52 
 
 
197 aa  139  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  42.94 
 
 
204 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  34.26 
 
 
228 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  42.68 
 
 
202 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  39.47 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  38.46 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  36.42 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  37.21 
 
 
212 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  38.96 
 
 
382 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  37.14 
 
 
239 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  39.74 
 
 
244 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  40.26 
 
 
208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  35.8 
 
 
252 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  39.22 
 
 
273 aa  112  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  38.31 
 
 
250 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  39.22 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  36.73 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  35.06 
 
 
219 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  36.59 
 
 
389 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  38.56 
 
 
235 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  35.19 
 
 
212 aa  108  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  36.6 
 
 
208 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  37.91 
 
 
291 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  36.36 
 
 
291 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  36.25 
 
 
249 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  37.89 
 
 
220 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  35.37 
 
 
243 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  34.78 
 
 
279 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  37.04 
 
 
239 aa  102  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  39.44 
 
 
250 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  33.12 
 
 
222 aa  102  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  34.39 
 
 
265 aa  100  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  36.42 
 
 
461 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  34.16 
 
 
268 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  35.06 
 
 
235 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  33.96 
 
 
256 aa  99.4  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  35.85 
 
 
211 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  37.7 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  34.88 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  30.8 
 
 
247 aa  97.1  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  31.43 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  34.94 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  33.33 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  31.79 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  32.74 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  35.29 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  34.64 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  32.7 
 
 
220 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  33.54 
 
 
306 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  32.93 
 
 
250 aa  85.5  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  39.1 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  39.1 
 
 
230 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1009  probable exclusion protein  60.47 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2928  hypothetical protein  42.42 
 
 
69 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0637736  normal  0.225214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>