61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2437 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  100 
 
 
265 aa  541  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  74.43 
 
 
222 aa  348  6e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  63.21 
 
 
273 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  61.14 
 
 
461 aa  251  9.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  57.84 
 
 
250 aa  228  5e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  54.76 
 
 
244 aa  225  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  62.01 
 
 
240 aa  224  8e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  59.44 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  55.61 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  57.75 
 
 
382 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  58.79 
 
 
211 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  59.24 
 
 
208 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  58.79 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  57.63 
 
 
389 aa  212  5.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  57.06 
 
 
249 aa  208  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  53.23 
 
 
291 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  58.72 
 
 
291 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  51.16 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  51.34 
 
 
208 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  51.35 
 
 
247 aa  194  9e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  51.32 
 
 
252 aa  193  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  41.43 
 
 
236 aa  188  7e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  44.28 
 
 
236 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  44.28 
 
 
236 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  44.28 
 
 
236 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  44.22 
 
 
236 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  43.72 
 
 
239 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  46.29 
 
 
252 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  41.79 
 
 
237 aa  149  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  39.5 
 
 
235 aa  145  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  43.79 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  40.88 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  41.03 
 
 
250 aa  131  9e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  38.89 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  42.68 
 
 
250 aa  126  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  35.68 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  37.77 
 
 
202 aa  107  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  34.97 
 
 
219 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  37.04 
 
 
211 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  34.39 
 
 
242 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  33.96 
 
 
211 aa  95.9  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  34.01 
 
 
212 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  34.92 
 
 
215 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  31.98 
 
 
214 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  33.67 
 
 
228 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  34.07 
 
 
199 aa  91.3  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  32.43 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  27.98 
 
 
272 aa  89.4  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  30.26 
 
 
226 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  32.02 
 
 
235 aa  88.6  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  36.02 
 
 
230 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  36.02 
 
 
230 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  29.6 
 
 
219 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  28.03 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  35.56 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  29.95 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  27.95 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  30.98 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  32.12 
 
 
204 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  30.97 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  27.68 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>