62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1520 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  66.49 
 
 
461 aa  269  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  59.18 
 
 
244 aa  269  4e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  63.24 
 
 
382 aa  268  7e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  63.94 
 
 
249 aa  268  8.999999999999999e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  67.39 
 
 
268 aa  265  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  66.3 
 
 
211 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  62.26 
 
 
250 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  63.78 
 
 
303 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  57.77 
 
 
222 aa  253  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  57.73 
 
 
389 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  59.82 
 
 
265 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  59.51 
 
 
208 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  64.41 
 
 
240 aa  240  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  62.64 
 
 
239 aa  234  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  56.16 
 
 
306 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  63.37 
 
 
291 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  58.47 
 
 
291 aa  228  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  55.84 
 
 
247 aa  223  4e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  57.92 
 
 
252 aa  218  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  51.63 
 
 
208 aa  209  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  53.85 
 
 
236 aa  205  5e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  46.96 
 
 
252 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  47.74 
 
 
236 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  47.74 
 
 
236 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  47.74 
 
 
236 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  44.44 
 
 
237 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  42.79 
 
 
279 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  44.72 
 
 
231 aa  165  6.9999999999999995e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  47.26 
 
 
239 aa  165  8e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  45.88 
 
 
235 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  45.18 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  41.41 
 
 
243 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  45.88 
 
 
220 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  47.4 
 
 
250 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  43.43 
 
 
215 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  41.44 
 
 
250 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  39.04 
 
 
212 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  37.38 
 
 
219 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  36.56 
 
 
219 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  34.36 
 
 
242 aa  115  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  37.37 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  37.82 
 
 
202 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  35.87 
 
 
214 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  36.31 
 
 
226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  31.95 
 
 
228 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  35.19 
 
 
272 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  36.36 
 
 
220 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  33.95 
 
 
220 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  35.45 
 
 
211 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  38.38 
 
 
230 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  38.38 
 
 
230 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  36.41 
 
 
249 aa  105  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  34.3 
 
 
235 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  31.14 
 
 
197 aa  95.9  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  35.67 
 
 
212 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  34.71 
 
 
204 aa  85.5  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  37.61 
 
 
170 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  29.94 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  28.7 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2148  hypothetical protein  76 
 
 
161 aa  43.9  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>