95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  100 
 
 		 389 aa  764    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  57.89 
 
 		 382 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  52.33 
 
 		 303 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  66.84 
 
 		 268 aa  268  8e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  65.78 
 
 		 211 aa  262  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  69.06 
 
 		 208 aa  261  1e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  68.89 
 
 		 461 aa  258  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  54.29 
 
 		 244 aa  249  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  61.58 
 
 		 250 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  64.32 
 
 		 273 aa  247  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  61.93 
 
 		 249 aa  241  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  60.51 
 
 		 240 aa  228  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  63.69 
 
 		 239 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  58.82 
 
 		 222 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  51.98 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  62.43 
 
 		 291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  57.71 
 
 		 265 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  54.21 
 
 		 208 aa  209  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  52.13 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  52.15 
 
 		 291 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  53.18 
 
 		 236 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  52.15 
 
 		 252 aa  187  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  47.94 
 
 		 252 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  48.21 
 
 		 231 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  48 
 
 		 239 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  47.56 
 
 		 220 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  43.85 
 
 		 243 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  42.31 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  44.26 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  42.31 
 
 		 236 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  41.86 
 
 		 236 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  42.31 
 
 		 236 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  44.63 
 
 		 237 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  46.82 
 
 		 250 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  38.89 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  42.16 
 
 		 250 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  34.12 
 
 		 215 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  33.5 
 
 		 272 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  36.59 
 
 		 242 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  36.45 
 
 		 202 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  33.7 
 
 		 249 aa  97.4  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  34.5 
 
 		 219 aa  96.7  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  35.33 
 
 		 212 aa  96.3  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  32.11 
 
 		 235 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  35.33 
 
 		 220 aa  94.4  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  35.33 
 
 		 211 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  34.66 
 
 		 214 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  33.52 
 
 		 219 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  37.72 
 
 		 211 aa  92.8  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  34.94 
 
 		 220 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  36.14 
 
 		 228 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  29.15 
 
 		 256 aa  85.5  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  33.54 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  39.33 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  39.33 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  33.71 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  31.49 
 
 		 226 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  37.39 
 
 		 199 aa  78.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  30.39 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  62.5 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  70.21 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  36.75 
 
 		 170 aa  67  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  62.75 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  66.67 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  63.89 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  63.89 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  63.89 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  63.89 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  63.89 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  63.89 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  63.89 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  56.6 
 
 		 212 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  56.76 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  46.77 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  46.77 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  46.88 
 
 		 272 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  46.88 
 
 		 272 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  58.33 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  46.88 
 
 		 272 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  47.46 
 
 		 266 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0723  hypothetical protein  72.22 
 
 		 142 aa  53.5  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  37.5 
 
 		 276 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  54.39 
 
 		 115 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  66.67 
 
 		 351 aa  50.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  52.78 
 
 		 233 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  45.9 
 
 		 272 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2148  hypothetical protein  76.92 
 
 		 161 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  63.04 
 
 		 154 aa  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  61.11 
 
 		 232 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  69.44 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  53.85 
 
 		 211 aa  44.7  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  43.62 
 
 		 268 aa  44.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  44.44 
 
 		 443 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  44.44 
 
 		 220 aa  43.1  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>