42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5183 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  100 
 
 
156 aa  296  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  76.32 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  76.32 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  76.32 
 
 
333 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  76.32 
 
 
303 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  76.32 
 
 
287 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  76.32 
 
 
333 aa  72  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  76.32 
 
 
318 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  73.68 
 
 
287 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  75.61 
 
 
349 aa  70.9  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  71.05 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  78.95 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  75.68 
 
 
351 aa  63.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  77.78 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  72.97 
 
 
382 aa  60.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  83.78 
 
 
115 aa  58.9  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  70.27 
 
 
212 aa  57.8  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  69.44 
 
 
389 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  61.11 
 
 
334 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  58.33 
 
 
77 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0723  hypothetical protein  78.38 
 
 
142 aa  54.7  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  63.89 
 
 
303 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  53.85 
 
 
272 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  53.85 
 
 
257 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  43.33 
 
 
625 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  53.85 
 
 
272 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  53.85 
 
 
272 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  53.85 
 
 
266 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  53.85 
 
 
268 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  53.85 
 
 
268 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  53.85 
 
 
272 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  53.85 
 
 
276 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0302  Excalibur domain protein  73.68 
 
 
319 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  73.68 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  68.42 
 
 
232 aa  48.1  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  72.97 
 
 
211 aa  47.4  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  54.05 
 
 
233 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  52.78 
 
 
443 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  70.27 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0102  Excalibur domain protein  54.05 
 
 
318 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  52.17 
 
 
251 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6539  Excalibur domain-containing protein  65.12 
 
 
211 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>