38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3801 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  100 
 
 
219 aa  430  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  89.74 
 
 
349 aa  84.7  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  64.1 
 
 
332 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  64.1 
 
 
331 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  64.1 
 
 
333 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  64.1 
 
 
333 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  64.1 
 
 
318 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  64.1 
 
 
287 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  61.54 
 
 
287 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  64.1 
 
 
303 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  75.68 
 
 
389 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  68.18 
 
 
138 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  59.09 
 
 
382 aa  62.4  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  61.54 
 
 
330 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  68.09 
 
 
115 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  52.08 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  48.72 
 
 
334 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  78.95 
 
 
156 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0102  Excalibur domain protein  29.28 
 
 
318 aa  55.1  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0723  hypothetical protein  75 
 
 
142 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  50 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  50 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  46.15 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  46.15 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  46.15 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  69.44 
 
 
351 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  47.92 
 
 
276 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  53.85 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  59.46 
 
 
303 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  48.98 
 
 
272 aa  52  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  55.56 
 
 
257 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  54.05 
 
 
77 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  47.37 
 
 
443 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  60 
 
 
154 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0302  Excalibur domain protein  64.1 
 
 
319 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12140  putative calcium-binding protein  38.64 
 
 
156 aa  42.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00153272  normal  0.0976113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  56.41 
 
 
232 aa  42  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  47.22 
 
 
233 aa  42  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>