61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0353 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  494  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  59.34 
 
 		 247 aa  293  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  53.26 
 
 		 273 aa  202  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  46.89 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  50 
 
 		 303 aa  193  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  52.81 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  47.17 
 
 		 389 aa  187  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  50.88 
 
 		 461 aa  186  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  48.21 
 
 		 382 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  47.74 
 
 		 211 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  51.81 
 
 		 265 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  46.52 
 
 		 222 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  48.4 
 
 		 208 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  47.17 
 
 		 240 aa  171  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  48.11 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  47.85 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  45.45 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  45 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  51.46 
 
 		 239 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  49.1 
 
 		 250 aa  167  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  44.92 
 
 		 291 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  41.86 
 
 		 239 aa  164  9e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  45.31 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  44.69 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  43.6 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  43.6 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  43.6 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  42.02 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  36.79 
 
 		 237 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  48.17 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  39.29 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  42.11 
 
 		 235 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  34.51 
 
 		 250 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  41.9 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  42.17 
 
 		 250 aa  128  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  39.52 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  35.26 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  34.1 
 
 		 215 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  35.48 
 
 		 211 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  36.75 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  34.36 
 
 		 202 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  33.67 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  34.16 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  36.97 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  33.68 
 
 		 249 aa  98.2  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  33.51 
 
 		 214 aa  98.2  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  35.76 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  30.94 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  34.64 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  31.72 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  36.67 
 
 		 197 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  31.15 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  34.13 
 
 		 219 aa  85.9  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  30.48 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  37.39 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  34.16 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  34.16 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  36.43 
 
 		 170 aa  72  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  29.35 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  33.12 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  33.63 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>