61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0128 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  100 
 
 
291 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  67.96 
 
 
239 aa  249  5e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  66.84 
 
 
249 aa  249  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  68.72 
 
 
268 aa  245  6.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  66.48 
 
 
382 aa  242  5e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  64.41 
 
 
461 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  62.3 
 
 
211 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  63.13 
 
 
273 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  59.28 
 
 
240 aa  229  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  56.16 
 
 
250 aa  225  8e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  59.18 
 
 
389 aa  223  3e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  56.59 
 
 
244 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  61.45 
 
 
303 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  56.91 
 
 
208 aa  215  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  60.67 
 
 
222 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  58.72 
 
 
265 aa  203  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  55.74 
 
 
208 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  48.51 
 
 
247 aa  192  4e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  53.41 
 
 
291 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  54.55 
 
 
252 aa  186  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  53.8 
 
 
306 aa  182  7e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  45 
 
 
236 aa  178  8e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  51.87 
 
 
252 aa  175  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  51.63 
 
 
220 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  43.46 
 
 
239 aa  158  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  46.35 
 
 
237 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  44.62 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  42.42 
 
 
236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  42.42 
 
 
236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  45.83 
 
 
236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  46.29 
 
 
243 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  42.42 
 
 
236 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  42.93 
 
 
279 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  47.53 
 
 
250 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  44.22 
 
 
231 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  48.57 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  41.92 
 
 
212 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  41.21 
 
 
211 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  30.4 
 
 
242 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  39.46 
 
 
215 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  37.3 
 
 
235 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  36.36 
 
 
272 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  35.19 
 
 
202 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  38.76 
 
 
211 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  39.78 
 
 
228 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  38.69 
 
 
219 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  37.99 
 
 
214 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  35.48 
 
 
220 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  31.51 
 
 
219 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  32.53 
 
 
197 aa  92.8  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  35.03 
 
 
220 aa  92.8  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  44.35 
 
 
199 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  35.91 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  36.31 
 
 
249 aa  89.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  38.46 
 
 
212 aa  89  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  40.59 
 
 
230 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  40.59 
 
 
230 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  35.75 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  38.89 
 
 
170 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  36.84 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  31.32 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>