62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4055 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  68.02 
 
 
250 aa  322  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  69 
 
 
208 aa  285  5e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  64.82 
 
 
273 aa  260  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  61.05 
 
 
240 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  62.9 
 
 
382 aa  250  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  58.77 
 
 
249 aa  248  6e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  54.74 
 
 
389 aa  240  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  61.9 
 
 
461 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  59.78 
 
 
211 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  58.1 
 
 
268 aa  226  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  58.38 
 
 
239 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  58.47 
 
 
303 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  58.48 
 
 
291 aa  221  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  54.59 
 
 
306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  56.91 
 
 
222 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  53.33 
 
 
252 aa  218  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  54.64 
 
 
291 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  54.76 
 
 
265 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  53.01 
 
 
208 aa  208  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  52.54 
 
 
247 aa  190  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  50.27 
 
 
252 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  45 
 
 
239 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  47.85 
 
 
236 aa  170  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  46.34 
 
 
231 aa  167  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  44.5 
 
 
220 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  35.92 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  40.67 
 
 
279 aa  148  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  42.93 
 
 
237 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  42.71 
 
 
250 aa  145  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  42.61 
 
 
235 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  42.86 
 
 
236 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  42.86 
 
 
236 aa  136  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  42.86 
 
 
236 aa  135  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  39.9 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  41.3 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  39.74 
 
 
242 aa  115  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  38.54 
 
 
202 aa  112  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  36.67 
 
 
230 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  36.67 
 
 
230 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  33.47 
 
 
215 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  38.74 
 
 
211 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  35.54 
 
 
228 aa  106  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  33.14 
 
 
219 aa  102  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  34.78 
 
 
220 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  35.26 
 
 
211 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  33.12 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  36.67 
 
 
197 aa  93.6  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  33.15 
 
 
212 aa  92.4  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  29.95 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  29.56 
 
 
214 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  30.27 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  32.42 
 
 
219 aa  85.5  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  35.09 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  31.74 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  29.8 
 
 
235 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  30.3 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  27.32 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  30.97 
 
 
256 aa  75.1  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  34.19 
 
 
170 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  30.12 
 
 
204 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2062  hypothetical protein  37.18 
 
 
544 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.770133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>