62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3140 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  65.41 
 
 		 211 aa  248  8e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  67.8 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  65.93 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  64.86 
 
 		 382 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  60.4 
 
 		 273 aa  238  8e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  64.32 
 
 		 240 aa  237  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  60.98 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  50.83 
 
 		 244 aa  229  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  62.09 
 
 		 461 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  57 
 
 		 208 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  60.73 
 
 		 303 aa  225  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  62.16 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  55.67 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  57.29 
 
 		 222 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  58.76 
 
 		 265 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  51.79 
 
 		 306 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  52.11 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  53.07 
 
 		 208 aa  195  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  53.37 
 
 		 252 aa  185  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  54.4 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  46.76 
 
 		 252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  51.46 
 
 		 236 aa  171  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  45.02 
 
 		 235 aa  165  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  47.92 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  47.92 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  47.92 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  41.56 
 
 		 243 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  51.41 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  44.5 
 
 		 231 aa  155  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  48.09 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  44.85 
 
 		 237 aa  151  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  44.85 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  50.65 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  40.49 
 
 		 239 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  43.6 
 
 		 279 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  35.17 
 
 		 215 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  39.09 
 
 		 212 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  38.27 
 
 		 202 aa  115  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  34.89 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  36.15 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  33.47 
 
 		 219 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  36.73 
 
 		 214 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  36.45 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  35.71 
 
 		 272 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  36.46 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  37.68 
 
 		 211 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  35.9 
 
 		 220 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  31.71 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  39.68 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  35.79 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  39.68 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  33.53 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  35.2 
 
 		 212 aa  85.5  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  36.11 
 
 		 256 aa  85.1  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  28.63 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  30.58 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  30.95 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  38.21 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  31.45 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  30.41 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2148  hypothetical protein  55.26 
 
 		 161 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>