12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2148 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2148  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  311  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  84.62 
 
 
382 aa  50.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  80.77 
 
 
268 aa  48.5  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  76.92 
 
 
389 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  76 
 
 
303 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  68.97 
 
 
239 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  76 
 
 
273 aa  44.3  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  75 
 
 
211 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  82.61 
 
 
461 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  78.26 
 
 
208 aa  42.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  76 
 
 
249 aa  42.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  71.43 
 
 
250 aa  41.6  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>