82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4287 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  100 
 
 		 303 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  61.54 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  66.39 
 
 		 268 aa  285  7e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  66.5 
 
 		 389 aa  271  9e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  62.77 
 
 		 273 aa  254  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  63.74 
 
 		 211 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  65.38 
 
 		 208 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  60.64 
 
 		 461 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  57.35 
 
 		 222 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  63.74 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  60.99 
 
 		 250 aa  234  9e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  58.06 
 
 		 244 aa  226  4e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  59.07 
 
 		 306 aa  221  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  60.22 
 
 		 239 aa  221  9e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  57.67 
 
 		 208 aa  220  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  53.69 
 
 		 265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  58.92 
 
 		 240 aa  216  5e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  61.27 
 
 		 291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  53.76 
 
 		 291 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  49.57 
 
 		 247 aa  203  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  43.78 
 
 		 236 aa  196  6e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  49.07 
 
 		 252 aa  195  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  50.54 
 
 		 252 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  48.66 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  45.57 
 
 		 220 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  47.28 
 
 		 239 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  47.43 
 
 		 236 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  47.43 
 
 		 236 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  47.43 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  45.5 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  45.45 
 
 		 236 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  45.14 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  41.46 
 
 		 237 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  44.56 
 
 		 250 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  41.84 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  42.93 
 
 		 250 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  31.65 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  36.68 
 
 		 215 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  39.47 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  37.62 
 
 		 202 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  39.38 
 
 		 212 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  38.95 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  36.97 
 
 		 220 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  35.98 
 
 		 235 aa  102  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  30.04 
 
 		 219 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  41.4 
 
 		 230 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  41.4 
 
 		 230 aa  102  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  37.37 
 
 		 214 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  37.3 
 
 		 211 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  37.33 
 
 		 197 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  38.61 
 
 		 220 aa  99.8  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  37.11 
 
 		 211 aa  99.4  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  37.28 
 
 		 219 aa  99.4  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  37.16 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  38.35 
 
 		 199 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  35.16 
 
 		 212 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  34.43 
 
 		 226 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  40.52 
 
 		 170 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  35.29 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  33.74 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  29.71 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  52.08 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  52.17 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  52.17 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  52.17 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  52.17 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  52.17 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  52.17 
 
 		 333 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  52.08 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  42.55 
 
 		 220 aa  54.3  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  55.56 
 
 		 287 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  59.46 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  57.5 
 
 		 351 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  47.5 
 
 		 334 aa  49.7  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  55.26 
 
 		 138 aa  49.7  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6539  Excalibur domain-containing protein  52.63 
 
 		 211 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  43.1 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  48.65 
 
 		 77 aa  46.6  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2148  hypothetical protein  76 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  57.14 
 
 		 115 aa  43.1  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  52.78 
 
 		 443 aa  42.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>