61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2160 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  511  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  68.02 
 
 
244 aa  337  8e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  77.3 
 
 
208 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  63.56 
 
 
249 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  66.15 
 
 
382 aa  265  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  65.13 
 
 
273 aa  258  7e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  63.02 
 
 
211 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  65.1 
 
 
461 aa  255  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  56.84 
 
 
389 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  61.58 
 
 
240 aa  248  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  63.69 
 
 
268 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  60.99 
 
 
303 aa  234  9e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  53.02 
 
 
306 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  55.61 
 
 
222 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  51.85 
 
 
265 aa  221  6e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  56.04 
 
 
208 aa  216  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  61.05 
 
 
291 aa  217  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  57.3 
 
 
239 aa  214  8e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  51.32 
 
 
252 aa  199  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  52.2 
 
 
291 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  51.98 
 
 
247 aa  187  9e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  45.45 
 
 
252 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  49.1 
 
 
236 aa  167  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  41.48 
 
 
239 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  44.39 
 
 
237 aa  158  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  44.92 
 
 
231 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  45.45 
 
 
235 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  45.16 
 
 
236 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  45.16 
 
 
236 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  45.16 
 
 
236 aa  153  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  43.56 
 
 
220 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  40.59 
 
 
243 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  43.85 
 
 
236 aa  148  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  40.41 
 
 
279 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  44.17 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  44.12 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  36.71 
 
 
215 aa  123  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  38.31 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  36.67 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  37.31 
 
 
212 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  34.44 
 
 
219 aa  105  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  37.95 
 
 
220 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  34.16 
 
 
214 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  33.66 
 
 
220 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0298613 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  35.52 
 
 
249 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  32.98 
 
 
226 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  36.46 
 
 
211 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  42.38 
 
 
230 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  42.38 
 
 
230 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  36.13 
 
 
211 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  33.8 
 
 
219 aa  99  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  33.97 
 
 
202 aa  98.2  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  34.36 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  34.44 
 
 
197 aa  91.7  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  31.16 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  33.72 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  33.13 
 
 
204 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  34.19 
 
 
199 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  30.85 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  27.64 
 
 
231 aa  72  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  35.04 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>