63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3199 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3199  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  504  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1983  hypothetical protein  57.46 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1937  hypothetical protein  57.46 
 
 		 236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.15913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4211  hypothetical protein  55.61 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.790434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12987  membrane or exported protein  55 
 
 		 237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1917  hypothetical protein  56.91 
 
 		 236 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2156  hypothetical protein  54.64 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.490202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2818  Domain of unknown function DUF1994  51.89 
 
 		 231 aa  189  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3140  hypothetical protein  48.95 
 
 		 239 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0142  hypothetical protein  46.81 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0758265  hitchhiker  0.0048896 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5392  hypothetical protein  45.45 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.664126  normal  0.295298 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4424  hypothetical protein  45.79 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1135  hypothetical protein  46.91 
 
 		 252 aa  142  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.446215 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0128  Domain of unknown function DUF1994  48.57 
 
 		 291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1886  hypothetical protein  47.62 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2187  hypothetical protein  43.65 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000250704 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3402  hypothetical protein  46.2 
 
 		 249 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4055  hypothetical protein  41.3 
 
 		 244 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  45.4 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0353  hypothetical protein  34.51 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0951  Excalibur domain-containing protein  42.18 
 
 		 461 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.353483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2741  hypothetical protein  47.31 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00247299  hitchhiker  0.00910563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  42.93 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2437  hypothetical protein  43.98 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145721  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  43.17 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0415  hypothetical protein  42.94 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0388856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1732  hypothetical protein  42.79 
 
 		 208 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4279  hypothetical protein  43.75 
 
 		 220 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.845853  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2239  hypothetical protein  43.71 
 
 		 211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  0.581311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2160  hypothetical protein  44.12 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0411791  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1520  hypothetical protein  41.44 
 
 		 273 aa  125  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1001  hypothetical protein  35.59 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  40.2 
 
 		 389 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1376  hypothetical protein  43.02 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0369  hypothetical protein  41.3 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5559  hypothetical protein  38.99 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0298613 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11046  conserved hypothetical protein  37.75 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3853  secreted protein  36.51 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6910  hypothetical protein  38.93 
 
 		 212 aa  92.4  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38220  protein of unknown function (DUF1994)  38.41 
 
 		 228 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0261  hypothetical protein  33.17 
 
 		 214 aa  89.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0161313  decreased coverage  0.000404846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0222  hypothetical protein  36 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.584066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4275  Domain of unknown function DUF1994  35.64 
 
 		 219 aa  88.6  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.651112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1094  hypothetical protein  37.01 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1634  hypothetical protein  30.81 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2568  hypothetical protein  32.93 
 
 		 242 aa  85.5  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0421  hypothetical protein  41.46 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.609894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26810  protein of unknown function (DUF1994)  36.99 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284972  normal  0.400066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3044  Domain of unknown function DUF1994  37.09 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5967  hypothetical protein  30.09 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0139  Domain of unknown function DUF1994  40 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.119645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0481  Domain of unknown function DUF1994  27.81 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.952883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1891  hypothetical protein  33.33 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4047  hypothetical protein  37.82 
 
 		 170 aa  71.6  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2276  secreted protein  37.43 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5884  hypothetical protein  37.95 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5484  hypothetical protein  37.95 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.671648 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4178  hypothetical protein  31.87 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00705375  normal  0.0874836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0227  hypothetical protein  35.16 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02560  protein of unknown function (DUF1994)  31.09 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2069  hypothetical protein  29.82 
 
 		 564 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0792  hypothetical protein  28.87 
 
 		 567 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>