27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2387 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  100 
 
 
233 aa  432  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  62.5 
 
 
443 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  62.16 
 
 
154 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  55.26 
 
 
115 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2181  Excalibur domain-containing protein  59.46 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  52.38 
 
 
287 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  59.46 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  55 
 
 
351 aa  49.7  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  51.35 
 
 
349 aa  48.9  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  57.5 
 
 
220 aa  48.5  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  52.78 
 
 
389 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  52.38 
 
 
333 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  55.26 
 
 
382 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  52.38 
 
 
332 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  52.38 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  52.38 
 
 
318 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  52.38 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  52.38 
 
 
333 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  52.38 
 
 
331 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0302  Excalibur domain protein  59.46 
 
 
319 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  54.05 
 
 
156 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  55.26 
 
 
212 aa  45.8  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  50 
 
 
334 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  48.89 
 
 
330 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0723  hypothetical protein  51.35 
 
 
142 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  50 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6539  Excalibur domain-containing protein  50 
 
 
211 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>