44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0844 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  100 
 
 		 115 aa  216  6e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  77.5 
 
 		 332 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  77.5 
 
 		 331 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  75 
 
 		 333 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  75 
 
 		 333 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  75 
 
 		 318 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  68.09 
 
 		 287 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  75 
 
 		 303 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  72.5 
 
 		 287 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  68.09 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  72.09 
 
 		 382 aa  71.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  65.22 
 
 		 349 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  67.5 
 
 		 330 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  70 
 
 		 351 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  58.49 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5183  Excalibur domain protein  83.78 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  63.89 
 
 		 389 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  69.44 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  57.5 
 
 		 334 aa  57  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  57.14 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  55.26 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0302  Excalibur domain protein  74.36 
 
 		 319 aa  53.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  55.26 
 
 		 233 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0723  hypothetical protein  70.27 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  70.27 
 
 		 232 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  71.79 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  61.82 
 
 		 220 aa  50.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  59.62 
 
 		 211 aa  48.5  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3466  Excalibur domain-containing protein  52.78 
 
 		 272 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4533  S-layer protein  28.32 
 
 		 257 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  50 
 
 		 443 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  51.16 
 
 		 625 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5054  S-layer protein  39.34 
 
 		 268 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4693  S-layer protein  39.34 
 
 		 268 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4918  putative S-layer protein  50 
 
 		 272 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4632  Excalibur domain-containing protein  50 
 
 		 266 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4952  S-layer protein, putative  50 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4550  S-layer protein  50 
 
 		 276 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2181  Excalibur domain-containing protein  67.57 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4937  putative S-layer protein  50 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  51.35 
 
 		 251 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0102  Excalibur domain protein  45.45 
 
 		 318 aa  40.8  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6539  Excalibur domain-containing protein  60.98 
 
 		 211 aa  40.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0048  Excalibur domain protein  69.57 
 
 		 268 aa  40  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.670171  normal  0.366242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>