35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2181 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2181  Excalibur domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  410  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  55.22 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  59.57 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  59.57 
 
 		 332 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  59.57 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  59.57 
 
 		 333 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  59.57 
 
 		 318 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  58.33 
 
 		 287 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  59.57 
 
 		 303 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  37.4 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  65.79 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  53.19 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5756  hypothetical protein  36.96 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.384038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4287  Domain of unknown function DUF1994  50 
 
 		 303 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.671447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  47.69 
 
 		 382 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  72.5 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  47.95 
 
 		 220 aa  52.4  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2387  Excalibur domain protein  59.46 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000276627  hitchhiker  0.000344764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3198  PASTA domain containing protein  43.94 
 
 		 125 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  51.06 
 
 		 138 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0952  Excalibur domain-containing protein  71.05 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0808637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  62.16 
 
 		 351 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  56.76 
 
 		 349 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0844  Excalibur domain protein  49.23 
 
 		 115 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  47.92 
 
 		 334 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  52.78 
 
 		 389 aa  48.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0302  Excalibur domain protein  76.32 
 
 		 319 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3801  Excalibur domain protein  55.56 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.533693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  36.99 
 
 		 625 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3890  hypothetical protein  36.99 
 
 		 154 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.59783  normal  0.188854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.36 
 
 		 681 aa  45.1  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3931  Excalibur domain protein  48.65 
 
 		 77 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1411  PASTA domain containing protein  37.78 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0723  hypothetical protein  62.16 
 
 		 142 aa  41.6  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6539  Excalibur domain-containing protein  42.17 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.199317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>